umu.sePublikationer
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A role for the Saccharomyces cerevisiae ABCF protein New1 in translation termination/recycling
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).ORCID-id: 0000-0002-2970-2001
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).ORCID-id: 0000-0003-4966-1291
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 47, nr 16, s. 8807-8820Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Translation is controlled by numerous accessory proteins and translation factors. In the yeast Saccharomyces cerevisiae, translation elongation requires an essential elongation factor, the ABCF ATPase eEF3. A closely related protein, New1, is encoded by a non-essential gene with cold sensitivity and ribosome assembly defect knock-out phenotypes. Since the exact molecular function of New1 is unknown, it is unclear if the ribosome assembly defect is direct, i.e. New1 is a bona fide assembly factor, or indirect, for instance due to a defect in protein synthesis. To investigate this, we employed yeast genetics, cryo-electron microscopy (cryo-EM) and ribosome profiling (Ribo-Seq) to interrogate the molecular function of New1. Overexpression of New1 rescues the inviability of a yeast strain lacking the otherwise strictly essential translation factor eEF3. The structure of the ATPase-deficient (EQ2) New1 mutant locked on the 80S ribosome reveals that New1 binds analogously to the ribosome as eEF3. Finally, Ribo-Seq analysis revealed that loss of New1 leads to ribosome queuing upstream of 3′-terminal lysine and arginine codons, including those genes encoding proteins of the cytoplasmic translational machinery. Our results suggest that New1 is a translation factor that fine-tunes the efficiency of translation termination or ribosome recycling.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Oxford University Press, 2019. Vol. 47, nr 16, s. 8807-8820
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-164896DOI: 10.1093/nar/gkz600ISI: 000490576900040PubMedID: 31299085OAI: oai:DiVA.org:umu-164896DiVA, id: diva2:1367802
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 2017-03783Vetenskapsrådet, 201504746Vetenskapsrådet, 2017-04663Ragnar Söderbergs stiftelseKempestiftelserna, JCK1627Kempestiftelserna, SMK-1349Magnus Bergvalls Stiftelse, 2017-02098Åke Wibergs Stiftelse, M14-0207EU, Horisont 2020, 2643Vetenskapsrådet, 2017-03783Tillgänglig från: 2019-11-05 Skapad: 2019-11-05 Senast uppdaterad: 2019-11-07

Open Access i DiVA

fulltext(10326 kB)10 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 10326 kBChecksumma SHA-512
388d5157d410e749aad74068e22a284cecd53264f6b5f0d9cdf06883e8f4aa64d1ff7192b728ffa833252c27ca20d63729a4ac7c7cc9127a38c744c771c518e5
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedURL

Personposter BETA

Kasari, VilluMargus, TonuMurina, VictoriiaTurnbull, Kathryn JaneZhou, YangAtkinson, Gemma C.Johansson, Marcus J. O.Hauryliuk, Vasili

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Kasari, VilluMargus, TonuMurina, VictoriiaTurnbull, Kathryn JaneZhou, YangAtkinson, Gemma C.Johansson, Marcus J. O.Hauryliuk, Vasili
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 10 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 39 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf