umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Training in High-Throughput Sequencing: Common Guidelines to Enable Material Sharing, Dissemination, and Reusability
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för fysiologisk botanik. Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Umeå Plant Science Centre (UPSC).
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för fysiologisk botanik. Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Umeå Plant Science Centre (UPSC). Department of Forest Genetics and Plant Physiology, Umeå Plant Science Centre, Swedish University of Agricultural Sciences, Umeå, Sweden.
2016 (Engelska)Ingår i: PloS Computational Biology, ISSN 1553-734X, E-ISSN 1553-7358, Vol. 12, nr 6, artikel-id e1004937Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Resurstyp
Text
Abstract [en]

The advancement of high-throughput sequencing (HTS) technologies and the rapid development of numerous analysis algorithms and pipelines in this field has resulted in an unprecedentedly high demand for training scientists in HTS data analysis. Embarking on developing new training materials is challenging for many reasons. Trainers often do not have prior experience in preparing or delivering such materials and struggle to keep them up to date. A repository of curated HTS training materials would support trainers in materials preparation, reduce the duplication of effort by increasing the usage of existing materials, and allow for the sharing of teaching experience among the HTS trainers' community. To achieve this, we have developed a strategy for materials' curation and dissemination. Standards for describing training materials have been proposed and applied to the curation of existing materials. A Git repository has been set up for sharing annotated materials that can now be reused, modified, or incorporated into new courses. This repository uses Git; hence, it is decentralized and self-managed by the community and can be forked/built-upon by all users. The repository is accessible at http://bioinformatics.upsc.se/htmr.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2016. Vol. 12, nr 6, artikel-id e1004937
Nationell ämneskategori
Bioinformatik (beräkningsbiologi)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-124349DOI: 10.1371/journal.pcbi.1004937ISI: 000379349700027PubMedID: 27309738OAI: oai:DiVA.org:umu-124349DiVA, id: diva2:1034524
Tillgänglig från: 2016-10-12 Skapad: 2016-08-04 Senast uppdaterad: 2018-06-09Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(861 kB)197 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 861 kBChecksumma SHA-512
7971461e90789337bda5d8a57d480f32af88e60994010bb6f5ac365b049f99962888727c82cf48101fba753e3017e1ee8c696e744aa084c126860c17ad8c8c72
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Schiffthaler, BastianDelhomme, Nicolas

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Schiffthaler, BastianDelhomme, Nicolas
Av organisationen
Institutionen för fysiologisk botanikUmeå Plant Science Centre (UPSC)
I samma tidskrift
PloS Computational Biology
Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 197 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 497 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf