umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Non-parametric spectral estimation techniques for DNA sequence analysis and exon region prediction
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: Computers & electrical engineering, ISSN 0045-7906, E-ISSN 1879-0755, Vol. 73, s. 334-348Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Bioinformatics is the analysis of biological information using computers and statistical techniques. This paper presents non-parametric spectral estimation techniques based on the Discrete Fourier Transform (DFT) for the analysis of deoxyribonucleic acid (DNA) sequences. These techniques are efficient frequency-domain signal representation techniques, which improve the analysis of DNA sequences and enable the extraction of some desirable information that cannot be extracted from the time-domain representation of these sequences. The adopted techniques are the periodogram, average periodogram (Bartlett), modified average periodogram (Welch), and Blackman and Tukey spectral estimation techniques. The objective of these spectral estimation techniques is to investigate the locations of exons in DNA sequences for gene prediction. A comparison study is presented in this paper between the suggested spectral estimation techniques from the exon prediction perspective. The methods presented in this paper improve the detectability of peaks representing exon regions.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Elsevier, 2019. Vol. 73, s. 334-348
Nyckelord [en]
Bioinformatics, DNA, Exon prediction, Genomic signal processing, Spectral estimation
Nationell ämneskategori
Datavetenskap (datalogi) Bioinformatik (beräkningsbiologi)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-156897DOI: 10.1016/j.compeleceng.2018.12.001ISI: 000458593900026OAI: oai:DiVA.org:umu-156897DiVA, id: diva2:1295060
Tillgänglig från: 2019-03-09 Skapad: 2019-03-09 Senast uppdaterad: 2019-03-09Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Hassan, Emadeldeen

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Hassan, Emadeldeen
Av organisationen
Institutionen för datavetenskap
I samma tidskrift
Computers & electrical engineering
Datavetenskap (datalogi)Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 172 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf