umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Structural studies of β-Carbonic Anhydrase from the Green Alga Coccomyxa: Inhibitor complexes with Anions and Acetazolamide
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Orphan Biovitrum AB, Umeå, Sweden. (Department of Chemistry, Umeå University, Umeå, Sweden)
Visa övriga samt affilieringar
2011 (Engelska)Ingår i: PLoS ONE, ISSN 1932-6203, E-ISSN 1932-6203, Vol. 6, nr 12, s. e28458-Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The β-class carbonic anhydrases (β-CAs) are widely distributed among lower eukaryotes, prokaryotes, archaea, and plants. Like all CAs, the β-enzymes catalyze an important physiological reaction, namely the interconversion between carbon dioxide and bicarbonate. In plants the enzyme plays an important role in carbon fixation and metabolism. To further explore the structure-function relationship of β-CA, we have determined the crystal structures of the photoautotroph unicellular green alga Coccomyxa β-CA in complex with five different inhibitors: acetazolamide, thiocyanate, azide, iodide, and phosphate ions. The tetrameric Coccomyxa β-CA structure is similar to other β-CAs but it has a 15 amino acid extension in the C-terminal end, which stabilizes the tetramer by strengthening the interface. Four of the five inhibitors bind in a manner similar to what is found in complexes with α-type CAs. Iodide ions, however, make contact to the zinc ion via a zinc-bound water molecule or hydroxide ion - a type of binding mode not previously observed in any CA. Binding of inhibitors to Coccomyxa β-CA is mediated by side-chain movements of the conserved residue Tyr-88, extending the width of the active site cavity with 1.5-1.8 Å. Structural analysis and comparisons with other α- and β-class members suggest a catalytic mechanism in which the movements of Tyr-88 are important for the CO(2)-HCO(3) (-) interconversion, whereas a structurally conserved water molecule that bridges residues Tyr-88 and Gln-38, seems important for proton transfer, linking water molecules from the zinc-bound water to His-92 and buffer molecules.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2011. Vol. 6, nr 12, s. e28458-
Nationell ämneskategori
Strukturbiologi Biokemi och molekylärbiologi
Forskningsämne
biokemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-50781DOI: 10.1371/journal.pone.0028458ISI: 000298172800038PubMedID: 22162771OAI: oai:DiVA.org:umu-50781DiVA, id: diva2:468763
Tillgänglig från: 2011-12-21 Skapad: 2011-12-21 Senast uppdaterad: 2018-06-08Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4359 kB)826 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.pdfFilstorlek 4359 kBChecksumma SHA-512
94873372afb9555df618ec437f6a740225770389b481653723607426f3a70f71878fba163693c6a0e82450dc404b97692ce9a2ebc6c34c736dda5a30c6769382
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Huang, ShenghuaHainzl, TobiasGrundström, ChristinSamuelsson, GöranSauer-Eriksson, A Elisabeth

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Huang, ShenghuaHainzl, TobiasGrundström, ChristinSamuelsson, GöranSauer-Eriksson, A Elisabeth
Av organisationen
Kemiska institutionenInstitutionen för fysiologisk botanikUmeå Centre for Microbial Research (UCMR)
I samma tidskrift
PLoS ONE
StrukturbiologiBiokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 826 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 518 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf