umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A dynamic interplay of nucleosome and Msn2 binding regulates kinetics of gene activation and repression following stress
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Visa övriga samt affilieringar
2014 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 42, nr 9, s. 5468-5482Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The transcription factor Msn2 mediates a significant proportion of the environmental stress response, in which a common cohort of genes changes expression in a stereotypic fashion upon exposure to any of a wide variety of stresses. We have applied genome-wide chromatin immunoprecipitation and nucleosome profiling to determine where Msn2 binds under stressful conditions and how that binding affects, and is affected by, nucleosome positioning. We concurrently determined the effect of Msn2 activity on gene expression following stress and demonstrated that Msn2 stimulates both activation and repression. We found that some genes responded to both intermittent and continuous Msn2 nuclear occupancy while others responded only to continuous occupancy. Finally, these studies document a dynamic interplay between nucleosomes and Msn2 such that nucleosomes can restrict access of Msn2 to its canonical binding sites while Msn2 can promote reposition, expulsion and recruitment of nucleosomes to alter gene expression. This interplay may allow the cell to discriminate between different types of stress signaling.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2014. Vol. 42, nr 9, s. 5468-5482
Nationell ämneskategori
Medicinsk genetik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-90879DOI: 10.1093/nar/gku176ISI: 000336495400015OAI: oai:DiVA.org:umu-90879DiVA, id: diva2:731504
Tillgänglig från: 2014-07-01 Skapad: 2014-07-01 Senast uppdaterad: 2018-06-07Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(15798 kB)168 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 15798 kBChecksumma SHA-512
c81a976fa26f92a6fd76ca3d023d3c45ad91f0c8c7b4caef224325be510a13055d3f0dd31d5a1d4e74b29d9f17aa6da7643e476462b4892c3a4385ddbf8fd7dc
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Elfving, NilsBjörklund, Stefan

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Elfving, NilsBjörklund, Stefan
Av organisationen
Institutionen för medicinsk kemi och biofysik
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
Medicinsk genetik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 168 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 339 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf