umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Auxotrophy-based High Throughput Screening assay for the identification of Bacillus subtilis stringent response inhibitors
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS). University of Tartu, Institute of Technology, Nooruse 1, 50411 Tartu, Estonia.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).
Visa övriga samt affilieringar
2016 (Engelska)Ingår i: Scientific Reports, ISSN 2045-2322, E-ISSN 2045-2322, Vol. 6, artikel-id 35824Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The stringent response is a central adaptation mechanism that allows bacteria to adjust their growth and metabolism according to environmental conditions. The functionality of the stringent response is crucial for bacterial virulence, survival during host invasion as well as antibiotic resistance and tolerance. Therefore, specific inhibitors of the stringent response hold great promise as molecular tools for disarming and pacifying bacterial pathogens. By taking advantage of the valine amino acid auxotrophy of the Bacillus subtilis stringent response-deficient strain, we have set up a High Throughput Screening assay for the identification of stringent response inhibitors. By screening 17,500 compounds, we have identified a novel class of antibacterials based on the 4-(6-(phenoxy) alkyl)-3,5-dimethyl-1H-pyrazole core. Detailed characterization of the hit compounds as well as two previously identified promising stringent response inhibitors-a ppGpp-mimic nucleotide Relacin and cationic peptide 1018 - showed that neither of the compounds is sufficiently specific, thus motivating future application of our screening assay to larger and more diverse molecular libraries.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2016. Vol. 6, artikel-id 35824
Nationell ämneskategori
Mikrobiologi Infektionsmedicin
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-127600DOI: 10.1038/srep35824ISI: 000385923600001PubMedID: 27775002OAI: oai:DiVA.org:umu-127600DiVA, id: diva2:1052657
Tillgänglig från: 2016-12-07 Skapad: 2016-11-16 Senast uppdaterad: 2018-06-09Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(729 kB)107 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 729 kBChecksumma SHA-512
8bd6c9c00574539f94ace3cecd2246eaf4b86fba5ec0bc7503012e02ae94c7b7ef45daa649c39c082bab4d27cfd5b117232fb8f8c9b41d7b3a9f9a1addfddbac
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Andresen, LiisVarik, ValloJimmy, SteffiLindberg, StinaHauryliuk, Vasili

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Andresen, LiisVarik, ValloJimmy, SteffiLindberg, StinaHauryliuk, Vasili
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)Kemiska institutionen
I samma tidskrift
Scientific Reports
MikrobiologiInfektionsmedicin

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 107 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 754 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf