umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Model-based Estimation of Computed Tomography Images
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för matematik och matematisk statistik.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för matematik och matematisk statistik. (Mathematical Statistics)ORCID-id: 0000-0001-5673-620X
2017 (Engelska)Manuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
Abstract [en]

There is a growing interest to get a fully MR based radiotherapy. The most important development needed is to obtain improved bone tissue estimation. Existing model-based methods have performed poorly on bone tissues. This paper aims to obtainimproved estimation of bone tissues. Skew-Gaussian mixture model (SGMM) isproposed to further investigate CT image estimation from MR images. The estimation quality of the proposed model is evaluated using leave-one-out cross-validation method on real data. In comparison with the existing model-based approaches, the approach utilized in this paper outperforms in estimation of bone tissues, especiallyon dense bone tissues.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2017. , s. 17
Nyckelord [en]
computed tomography; magnetic resonance imaging; CT image estimation; model-based estimation; skew-normal mixture model
Nationell ämneskategori
Sannolikhetsteori och statistik Medicinsk bildbehandling
Forskningsämne
matematisk statistik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-141546OAI: oai:DiVA.org:umu-141546DiVA, id: diva2:1155313
Projekt
Statistical modelling and intelligent data sampling in MRI and PET measurements for cancer therapy assessment
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 340-2013-5342Tillgänglig från: 2017-11-07 Skapad: 2017-11-07 Senast uppdaterad: 2018-06-09
Ingår i avhandling
1. Statistical methods in medical image estimation and sparse signal recovery
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Statistical methods in medical image estimation and sparse signal recovery
2018 (Engelska)Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
Abstract [en]

This thesis presents work on methods for the estimation of computed tomography (CT) images from magnetic resonance (MR) images for a number of diagnostic and therapeutic workflows. The study also demonstrates sparse signal recovery method, which is an intermediate method for magnetic resonance image reconstruction. The thesis consists of four articles. The first three articles are concerned with developing statistical methods for the estimation of CT images from MR images. We formulated spatial and non-spatial models for CT image estimation from MR images, where the spatial models include hidden Markov model (HMM) and hidden Markov random field model (HMRF) while the non-spatial models incorporate Gaussian mixture model (GMM) and skewed-Gaussian mixture model (SGMM). The statistical models are estimated via a maximum likelihood approach using the EM-algorithm in GMM and SGMM, the EM gradient algorithm in HMRF and the Baum–Welch algorithm in HMM. We have also examined CT image estimation using GMM and supervised statistical learning methods. The performance of the models is evaluated using cross-validation on real data. Comparing CT image estimation performance of the models, we have observed that GMM combined with supervised statistical learning method has the best performance, especially on bone tissues. The fourth article deals with a sparse modeling in signal recovery. Using spike and slab priors on the signal, we formulated a sparse signal recovery problem and developed an adaptive algorithm for sparse signal recovery. The developed algorithm has better performance than the recent iterative convex refinement (ICR) algorithm. The methods introduced in this work are contributions to the lattice process and signal processing literature. The results are an input for the research on replacing CT images by synthetic or pseudo-CT images, and for an efficient way of recovering sparse signal.

Abstract [sv]

Denna avhandling presenterar arbete kring metoder för skattning av datortomografibilder (CT) från magnetiska resonanstomografibilder (MR) för ett antal diagnostiska och terapeutiska arbetsflöden. Studien demonstrerar även en metod för gles signalrekonstruktion, vilket är en mellanliggande metod för rekonstruktion av MR-bilder. Avhandlingen består av fyra artiklar. De tre första artiklarna handlar om att utveckla statistiska metoder för uppskattning av CT-bilder från MR-bilder. Här formuleras rumsliga och icke-rumsliga modeller för skattning av CT-bilder från MR-bilder, där de rumsliga modellerna inkluderar dolda Markov-modeller (HMM) och dolda Markov-slumpfältmodeller (HMRF), medan de icke-rumsliga modellerna består av Gaussiska mix-modeller (GMM) och skeva Gaussiska mixmodeller (SGMM). De statistiska modellerna skattas via en maximum-likelihoodansats, där EM-algoritmen används för GMM och SGMM, EM-gradientalgoritmen för HMRF samt Baum-Welch-algoritmen för HMM. Vi har även undersökt CTbildskattning med hjälp av GMM och övervakade statistiska inlärningsmetoder. Modellernas prestanda har utvärderats med hjälp av korsvalidering på faktiska data. Genom att jämföra prestandan hos modellernas CT-bildskattningar har vi observerat att GMM kombinerat med övervakad statistisk inlärning har den bästa prestandan, i synnerhet ifråga om benvävnad. Den fjärde artikeln behandlar en gles modellering inom signalrekonstruktion. Med hjälp av så kallade ”spike and slab priors” för signalen formulerade vi ett glest signalrekonstruktionsproblem och utvecklade en adaptiv algoritm för gles signalrekonstruktion. Den utvecklade algoritmen har bättre prestanda än den nyligen föreslagna iterativ konvex förfining (ICR)-algoritmen. De metoder som introducerats i detta arbete är bidrag till litteraturen inom så kallade ”lattice-processer” och signalbehandling. Resultaten levererar ett bidrag till forskningen kring ersättandet av CT-bilder med syntetiska eller pseudo-CTbilder, samt till effektiv gles signalrekonstruktion.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Umeå: Umeå University, 2018. s. 59
Serie
Research report in mathematical statistics, ISSN 1653-0829 ; 63
Nyckelord
Computed tomography, magnetic resonance imaging, Gaussian mixture model, skew-Gaussian mixture model, hidden Markov random field, hidden Markov model, supervised statistical learning, synthetic CT images, pseudo-CT images, spike and slab prior, adaptive algorithm
Nationell ämneskategori
Sannolikhetsteori och statistik Radiologi och bildbehandling
Identifikatorer
urn:nbn:se:umu:diva-147751 (URN)978-91-7601-890-3 (ISBN)
Disputation
2018-06-08, MA121, MIT-building, Umeå, 13:00 (Engelska)
Opponent
Handledare
Tillgänglig från: 2018-05-18 Skapad: 2018-05-16 Senast uppdaterad: 2018-06-09Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

arXiv:1705.03799

Personposter BETA

Bayisa, FekaduYu, Jun

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Bayisa, FekaduYu, Jun
Av organisationen
Institutionen för matematik och matematisk statistik
Sannolikhetsteori och statistikMedicinsk bildbehandling

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 513 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf