umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Syntrophy emerges spontaneously in complex metabolic systems
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för matematik och matematisk statistik. Santa Fe Institute, Santa Fe, New Mexico, United States of America.ORCID-id: 0000-0002-6569-5793
2019 (Engelska)Ingår i: PloS Computational Biology, ISSN 1553-734X, E-ISSN 1553-7358, Vol. 15, nr 7, artikel-id e1007169Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Syntrophy allows a microbial community as a whole to survive in an environment, even though individual microbes cannot. The metabolic interdependence typical of syntrophy is thought to arise from the accumulation of degenerative mutations during the sustained co-evolution of initially self-sufficient organisms. An alternative and underexplored possibility is that syntrophy can emerge spontaneously in communities of organisms that did not co-evolve. Here, we study this de novo origin of syntrophy using experimentally validated computational techniques to predict an organism's viability from its metabolic reactions. We show that pairs of metabolisms that are randomly sampled from a large space of possible metabolism and viable on specific primary carbon sources often become viable on new carbon sources by exchanging metabolites. The same biochemical reactions that are required for viability on primary carbon sources also confer viability on novel carbon sources. Our observations highlight a new and important avenue for the emergence of metabolic adaptations and novel ecological interactions.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Public Library Science , 2019. Vol. 15, nr 7, artikel-id e1007169
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-162885DOI: 10.1371/journal.pcbi.1007169ISI: 000481577700033PubMedID: 31339876OAI: oai:DiVA.org:umu-162885DiVA, id: diva2:1348367
Tillgänglig från: 2019-09-04 Skapad: 2019-09-04 Senast uppdaterad: 2019-09-04Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2803 kB)94 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 2803 kBChecksumma SHA-512
701502e8c25cea49259d585031de67d6a92ec39c8dd5f0e9b9e585d3e126cfcb3f9e94c2c173521b34cf51097836df4444d013f38dc2cc07542a1536d373211e
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Libby, Eric

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Libby, EricHosseini, Sayed-Rzgar
Av organisationen
Institutionen för matematik och matematisk statistik
I samma tidskrift
PloS Computational Biology
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 94 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 321 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf