Umeå University's logo

umu.sePublications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Gene expression profiling in MOLT-4 cells during gamma-radiation-induced apoptosis
Umeå University, Faculty of Medicine, Department of Clinical Microbiology, Immunology/Immunchemistry.
Umeå University, Faculty of Medicine, Department of Clinical Microbiology, Immunology/Immunchemistry.
Umeå University, Faculty of Medicine, Department of Radiation Sciences, Diagnostic Radiology.ORCID iD: 0000-0001-5227-8117
Umeå University, Faculty of Medicine, Department of Radiation Sciences, Radiation Physics.
Show others and affiliations
2012 (English)In: Tumor Biology, ISSN 1010-4283, E-ISSN 1423-0380, Vol. 33, no 3, p. 689-700Article in journal (Refereed) Published
Abstract [en]

This study aims to identify the temporal changes in gene expression in MOLT-4, a leukemia cell line, in response to radiation and to present a comprehensive description of the pathways and processes that most significantly relate to the cellular biological responses. A global gene expression profile of 24,500 genes was performed on MOLT-4 tumor cells following exposure to 5 Gy of ionizing radiation (Co-60) using a bead chip array (Illumina). Signaling pathways and processes significantly altered following irradiation were explored using MetaCore. Cellular viability [3-(4,5 dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide], activation of cell cycle checkpoints [fluorescence activated cell sorting (FACS)], and induction of apoptosis (FACS, caspase assays) were evaluated to correlate these biological responses to the gene expression changes. Totally, 698 different genes displayed a significantly altered expression following radiation, and out of these transcripts, all but one showed increased expression. One hour following irradiation, the expression was changed only for a few genes. Striking changes appeared at later time-points. From 3 to 24 h post-irradiation, a significant fraction of the genes with altered expression were found to be involved in cell cycle checkpoints and their regulation (CDKN1A), DNA repair (GADD45A, DDB2, XPC), apoptosis induction (DR5, FasR, Apo-2L, Bax), and T-cell activation/proliferation (CD70, OX40L). Irradiated MOLT-4 cells were arrested at the G2-checkpoint, followed by a decrease in cell viability, most pronounced 48 h after exposure. The cell death was executed by induced apoptosis and was visualized by an increase in subG1 cells and an increased activation of initiator (caspase-8 and caspase-9) and execution (caspase-3) caspases. Activation of cell cycle arrest and apoptosis correlated well in time with the changes in gene expression of those genes important for these biological processes. Activation of the apoptotic signaling pathways in MOLT-4 cells following irradiation includes components from the intrinsic as well as the extrinsic apoptotic pathways. This study indicates that the altered gene expression pattern induced by irradiation is important for the sequential steps observed in MOLT-4 cells during apoptosis induction.

Place, publisher, year, edition, pages
2012. Vol. 33, no 3, p. 689-700
Keywords [en]
Apoptosis, Radiation, Gene expression, Leukemia, Microarray
National Category
Immunology in the medical area
Identifiers
URN: urn:nbn:se:umu:diva-56209DOI: 10.1007/s13277-012-0329-zISI: 000303530200013Scopus ID: 2-s2.0-84863576162OAI: oai:DiVA.org:umu-56209DiVA, id: diva2:532929
Available from: 2012-06-12 Created: 2012-06-12 Last updated: 2023-03-24Bibliographically approved
In thesis
1. Optimizing experimental radioimmunotherapy: investigating the different mechanisms behind radiation induced cell deaths
Open this publication in new window or tab >>Optimizing experimental radioimmunotherapy: investigating the different mechanisms behind radiation induced cell deaths
2013 (English)Doctoral thesis, comprehensive summary (Other academic)
Alternative title[sv]
Optimering av experimentell radioimunoterapi : utredning av de olika mekanismerna bakom strålningsinducerade celldöder
Abstract [en]

Background. Radiation therapy is an important treatment regimen for malignant disease. Radiation therapy uses ionizing radiation to induce DNA damage in tumor cells in order to kill them. Tumor cells are more sensitive than normal cells, since they have an increased proliferation rate and often lack the ability to properly repair the induced damage. Radiation can be delivered by an external source outside the body, by brachytherapy delivered inside the patient near the tumor, or systemically by injection into the blood stream. When delivered systemically, the radiation is administered as radioisotope alone or conjugated to antibodies targeting tumor antigens (radioimmunotherapy). Radiotherapy (RT) usually is administered using high doses, causing necrotic cell death. Low doses of radiation (by RT or RIT) have been observed to induce different types of cell deaths, like apoptosis, mitotic catastrophe or senescence.Aims. We wanted to elucidate the molecular and cellular events responsible for the induction of cell death in cells of different origin and p53 status. We also wanted to identify the kinetics behind gene expression alterations induced in response to irradiation and correlate these to cell death specific molecular and cellular events. In the end this research aims to identify key regulators of the main radiation induced cell death modalities in order to improve our understanding and potentially use this knowledge to increase treatment efficacy of radiation therapy.

Methods. Four different cell lines were used in these studies to elucidate the role of p53 status cell origin in radiation induced cell death. HeLa Hep2 tumor cells have been used previously in our group in several RIT and RT studies. During these studies we observed morphological alterations in shrinking tumors that were typical for mitotic catastrophe. This led to studies on the underlying mechanisms causing these aberrations. Isogenic solid tumor cell lines HCT116 p53 +/+ and HCT116 p53 -/- were included to further elucidate the role of p53, and also to study senescence, one of the main outcomes in irradiated tumor cells. MOLT-4 was finally included to compare these finding to classical apoptosis. Gene expression analysis was done using Illumina bead chip arrays, and pathway analysis was performed using MetaCore (Thomson Reuters).

Results. In paper I, II, and III, transient G2/M arrests were observed in HeLa Hep2 and HCT116 p53 -/- cells following irradiation. The lack of p53 in these cells caused checkpoint adaptation due to an unscheduled accumulation of genes promoting mitosis. Anaphase bridges were observedivin HeLa Hep2 cells, as a consequence of premature mitotic entry with unrepaired DNA damage. Centrosome amplification, as well as deregulation of genes involved in centrosome amplification and clustering was observed in both cell lines. We observed changes in expression of several genes responsible for maintaining the spindle assembly checkpoint (SAC) arrest. A prolonged SAC arrest has been shown to be important for execution of mitotic catastrophe. SAC activation was followed by mitotic slippage and a subsequent failure of cytokinesis. We observed multipolar mitoses (both cell lines), multiple- and micronuclei (HeLa Hep2, paper I), and an increased frequency of tetraploid cells (HeLa Hep2 and HCT116 p53 -/- cells). A fraction of HeLa Hep2 cells also displayed apoptotic features, including caspase activation and DNA fragmentation (paper I). These findings indicate that mitotic catastrophe and the activation of a delayed type of apoptosis are involved in cell death following RIT.HCT116 p53 +/+ cells induced both G1 and G2 arrest following irradiation (paper III). Gene expression analysis revealed significantly decreased expression of genes responsible for cell cycle progression (pronounced decrease compared to HeLa Hep2 and HCT116 p53 -/-), especially mitotic genes. The prolonged arrest transitioned into senescence starting 3 days following irradiation and peaked after 7 days. Several genes associated with SASP were upregulated in the same time frame as senescence was induced, further supporting the fact that senescence is the main radiation induced response in HCT116 p53 +/+ cells.MOLT-4 cells, similar to HCT116 p53 +/+ cells, induced both G1 and G2 arrests in response to irradiation (paper IV). Morphological studies revealed apoptotic features like shrunken cells with condensed DNA. Caspase assays showed increased activity of caspases -3, -8, and -9. Gene expression analysis confirmed an increased expression of genes important for both extrinsic (FAS and TRAIL) and intrinsic (BAX) apoptosis. Furthermore, changed expression also included genes involved in cell cycle checkpoints and their regulation and genes important for T-cell activation/proliferation.

Conclusions. RIT is successfully used to treat lymphoma, but treatment of solid tumors with RIT is still difficult. This thesis elucidates cellular alterations characteristic for the 3 main radiation death modalities, i.e. mitotic catastrophe, senescence and apoptosis. Furthermore, cell death specific traits are correlated to alterations in gene expression. Treatment efficacy can potentially be improved by finding key cell death mediators to inhibit in combination with radiation.

Abstract [sv]

Bakgrund. Strålbehandling används för att bota eller lindra symptomen av cancer och består av joniserande strålning vars syfte är att skada DNAt i cellerna vilket leder till att de dör. Tumörceller är känsligare för strålning än normala celler eftersom de delar sig i snabbare takt och ofta saknar förmågan att reparera skadorna som uppstår. Det finns flera typer av strålbehandling: extern strålbehandling, d.v.s. när strålkällan är placerad utanför kroppen, brachyterapi, när strålkällan placeras i en kapsel inuti kroppen, eller systemisk strålning, där en radioisotop injiceras, antingen själv eller kopplad till en antikropp, då kallad radioimmunoterapi (RIT). Vid extern strålbehandling använder man sig ofta av relativt höga doser av strålning under ett kortare tidsintervall. Dessa celler dör ofta en nekrosliknande död. Med RIT kan man behandla patienterna med lägre doser under en längre tid och strålningen kan riktas specifikt till tumören, vilket minskar risken för bieffekter. Dessa celler dör av andra former av celldöd, apoptos, senescence eller mitotisk katastrof. Apoptos är för många synonymt med programmerad celldöd, och sker till exempel i respons till DNA skada. En apoptotisk cell känns igen på sitt utseende med fragmenterat DNA, nedbrutet cytoskelett och apoptotiska kroppar. Senescence är associerat med cellens åldrande men kan även orsakas av DNA-skador, och är en vanlig form av celldöd hos solida tumörceller med funktionell p53-signalering. Bestrålade solida tumörceller som saknar p53-signalering, antingen på grund av mutationer eller på grund av virusinducerad inaktivering, dör oftast i en helt annan celldöd, kallad mitotisk katastrof. Avsaknad av p53 leder till att en cell som erhållit skador på DNAt inte klarar av att uppehålla cellcykeln länge nog för att reparera skadorna. Inte heller apoptos induceras, eftersom p53 saknas. Detta leder till att cellen kommer att gå in i mitos med skador i sitt DNA som ej hunnit repareras. Celler i mitotisk katastrof har ett väldigt typiskt utseende med multipla kärnor, mikrokärnor (kromosomrester), multipla centrosomer och multipolära mitotiska spindlar. En del celler dör i mitosen medan andra försöker dela sig och kan överleva i flera generationer till, dock med skador på DNA. Målet med denna avhandling var att utreda de molekylära och transkriptionella mekanismerna bakom strålningsinducerad celldöd, och p53s roll i detta. Dessa studier kan så småningom leda till att viktiga regulatoriska proteiner av de strålnigsinducerade celldödsmekanismerna kan identifieras. Specifika inhibitorer riktade mot dessa proteiner kan med ökad kunskap strategiskt användas i kombination med strålning och potentiellt leda till förbättrade behandlingseffekter.

Metoder. Vi använde fyra cellinjer med olika bakgrund och p53 status. Vi har tidigare studerat HeLa Hep2 (en solid tumörcellslinje infekterad medviHPV som slår ut funktionen av p53) och sett vid både RT och RIT studier, att cellernas morfologi avviker från klassiks apoptos (stora celler med stora mängder DNA, istället för små celler med lite DNA). Detta ledde till studier av mekanismerna bakom denna avvikande cellmorfologin, som är typisk för mitotisk katastrof. Vi utökade studien med HCT116 p53 +/+ och HCT116 p53 -/- som är identiska så när som på p53, där ena cellinjen saknar denna gen. Detta skulle ge ökad förståelse för p53s roll vid mitotisk katastrof och även visa mekanismerna bakom senescence, en annan vanlig celldödsmekanism i strålade solida tumörceller. Även MOLT-4 inkluderades i studien för att kunna jämföra våra resultat med en cellinje som genomgår klassisk apoptos och är mer känslig för strålning.

Resultat. I celler där mitotisk katastrof inducerades efter strålning (HeLa Hep2, HCT116 p53-/-) såg vi ett övergående G2 arrest. Eftersom cellerna inte klarade av att underhålla detta arrest, då de saknar p53, fortsatte de in i nästa fas av cellcykeln, mitos. Detta ledde till att DNA skador kvarstod och en ökad frekvens av anafasbryggor. Dessutom skedde en centrosomamplifiering i dessa celler vilket gav upphov till multipolära mitotiska spindlar och en efterföljande icke fungerande cytokines. Detta gav i sin tur celler med multipla kärnor eller mikrokärnor. En ökad frekvens av tetraploida och polyploidaEn förändrad expression av gener som kunde kopplas till flera av dessa för mitotisk katastrof specifika karaktäristika observerades också. Flera gener associerade med reglering av centrosomen och dess amplifiering, med kontrollen av cellens progression från G2 till M-fasen av cellcykeln, samt involverade i kontrollen av en rätt utförd mitos (SAC) hade en ändrad genexpression som korrelerade väl i tid med de ovan nämda fenotyperna. Caspaser som är viktiga för apoptos visade sig vara aktiva i HeLa Hep2, vilket indikerar att mitotisk katastrof kan leda till fördröjd apoptos. Men en del celler lyckas smita undan från apoptosinduktionen och fortsätter i en ny runda i cellcykeln, och detta kunde ses som en växande population viabla celler med ökad mängd DNA (tetraploida celler).HCT116 p53 +/+ celler som har funktionellt p53 kunde inducera både G1 and G2 arrest och genexpressionen visade att många gener som styr övergången till mitos var nedreglerade och förhindrade detta (till skillnad från HeLa Hep2 och HCT116 p53 -/-, där dessa nivåer var högre). Dessa arrester övergick till senescence 3 dagar efter strålning och många gener kopplade till senescence visade ett ökat uttryck. Vi såg ingen markant ökning av centrosomer eller polyploida celler vilket skiljde sig från HeLa Hep2 och HCT116 p53 -/-. Detta tyder på att senescence skiljer sig markant åt från mitotisk katastrof och att p53 är viktig för induktionen av denna form av celldöd.viiVi såg att MOLT-4, precis som HCT116 p53 +/+, inducerar både G1 and G2 arrest. Denna arrest resulterade dock i ökad expression av gener viktiga för cellcykelarrest och apoptosinduktion, och vi såg även en ökad aktivitet av caspaser. Morfologiska studier visade att strålade MOLT-4 celler ofta var små och hade kondenserat DNA, vilket är typiska kännetecken för apoptos. Strålning av MOLT-4 celler ledde till aktivering av klassisk apoptos, och tidsförloppet var mycket snabbare jämfört med de övriga cellinjerna.

Slutsats. RIT är en framgångsrik metod för att behandla hematologiska maligniteter, men solida tumörer svarar fortfarande dåligt på denna form av behandling. Denna avhandling visar på komplexiteten bakom strålningsinducerad celldöd och att det är viktigt att identifiera de reglerande mekanismerna för att kunna förbättra RIT av solida tumörer. Vi visar även på vikten av p53 vad gäller tumörens respons av strålbehandling. Genom att identifiera viktiga proteiner för mitotisk katastrof, senescence, och apoptos, kan man utveckla inhibitorer mot dessa och använda de i kobination med RT och RIT för att förbättra behandlingseffekten.

Place, publisher, year, edition, pages
Umeå: Umeå Universitet, 2013. p. 63
Series
Umeå University medical dissertations, ISSN 0346-6612 ; 1594
Keywords
mitotic catastrophe, senescence, cell cycle checkpoint, apoptosis, radiation, gene expression, p53
National Category
Cell and Molecular Biology
Research subject
Immunology; radiation physics
Identifiers
urn:nbn:se:umu:diva-80232 (URN)978-91-7459-717-2 (ISBN)
Public defence
2013-10-04, By 6E sal E04, Norrlands universitetssjukhus, Umeå, 09:00 (English)
Opponent
Supervisors
Available from: 2013-09-13 Created: 2013-09-12 Last updated: 2018-06-08Bibliographically approved

Open Access in DiVA

No full text in DiVA

Other links

Publisher's full textScopus

Authority records

Lindgren, TheresStigbrand, TorgnyRiklund, KatrineJohansson, LennartEriksson, David

Search in DiVA

By author/editor
Lindgren, TheresStigbrand, TorgnyRiklund, KatrineJohansson, LennartEriksson, David
By organisation
Immunology/ImmunchemistryDiagnostic RadiologyRadiation Physics
In the same journal
Tumor Biology
Immunology in the medical area

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetric score

doi
urn-nbn
Total: 348 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf