umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
An evolutionary ratchet leading to loss of elongation factors in eukaryotes
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). University of Tartu, Institute of Technology, Nooruse 1, 50411 Tartu, Estonia .
University of Tartu, Institute of Technology, Nooruse 1, 50411 Tartu, Estonia & Department of Molecular Biology, Faculty of Biology, Moscow State University, Moscow, Russia .
Department of Molecular Biology, Faculty of Biology, Moscow State University, Moscow, Russia.
University of Tartu, Institute of Technology, Nooruse 1, 50411 Tartu, Estonia .
Visa övriga samt affilieringar
2014 (Engelska)Ingår i: BMC Evolutionary Biology, ISSN 1471-2148, E-ISSN 1471-2148, Vol. 14, s. 35-Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Background: The GTPase eEF1A is the eukaryotic factor responsible for the essential, universal function of aminoacyl-tRNA delivery to the ribosome. Surprisingly, eEF1A is not universally present in eukaryotes, being replaced by the paralog EFL independently in multiple lineages. The driving force behind this unusually frequent replacement is poorly understood. Results: Through sequence searching of genomic and EST databases, we find a striking association of eEF1A replacement by EFL and loss of eEF1A's guanine exchange factor, eEF1Ba, suggesting that EFL is able to spontaneously recharge with GTP. Sequence conservation and homology modeling analyses indicate several sequence regions that may be responsible for EFL's lack of requirement for eEF1Ba. Conclusions: We propose that the unusual pattern of eEF1A, eEF1Ba and EFL presence and absence can be explained by a ratchet-like process: if either eEF1A or eEF1Ba diverges beyond functionality in the presence of EFL, the system is unable to return to the ancestral, eEF1A:eEFBa-driven state.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2014. Vol. 14, s. 35-
Nyckelord [en]
eEF1A, EFL, eEF1B, Ribosome, Elongation factor, GTPase, GEF, Molecular evolution, Eukaryotes
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-88968DOI: 10.1186/1471-2148-14-35ISI: 000334457000001OAI: oai:DiVA.org:umu-88968DiVA, id: diva2:718594
Tillgänglig från: 2014-05-21 Skapad: 2014-05-19 Senast uppdaterad: 2018-06-07Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2777 kB)118 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 2777 kBChecksumma SHA-512
1865b68bce557b8c2919a1bece6b677d0911c07be3530fc1c826a012aff84dcb13df072ec1653acf0d8a8df144f1676acd5cfe483d840b95709dfea8c357e3cd
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Atkinson, Gemma C.

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Atkinson, Gemma C.
Av organisationen
Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)
I samma tidskrift
BMC Evolutionary Biology
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 118 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 385 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf