umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Biogenesis pathways of RNA guides in archaeal and bacterial CRISPR-Cas adaptive immunity
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).
2015 (Engelska)Ingår i: FEMS Microbiology Reviews, ISSN 0168-6445, E-ISSN 1574-6976, Vol. 39, nr 3, s. 428-441Artikel, forskningsöversikt (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

CRISPR-Cas is an RNA-mediated adaptive immune system that defends bacteria and archaea against mobile genetic elements. Short mature CRISPR RNAs (crRNAs) are key elements in the interference step of the immune pathway. A CRISPR array composed of a series of repeats interspaced by spacer sequences acquired from invading mobile genomes is transcribed as a precursor crRNA (pre-crRNA) molecule. This pre-crRNA undergoes one or two maturation steps to generate the mature crRNAs that guide CRISPR-associated (Cas) protein(s) to cognate invading genomes for their destruction. Different types of CRISPR-Cas systems have evolved distinct crRNA biogenesis pathways that implicate highly sophisticated processing mechanisms. In Types I and III CRISPR-Cas systems, a specific endoribonuclease of the Cas6 family, either standalone or in a complex with other Cas proteins, cleaves the pre-crRNA within the repeat regions. In Type II systems, the trans-acting small RNA (tracrRNA) base pairs with each repeat of the pre-crRNA to form a dual-RNA that is cleaved by the housekeeping RNase III in the presence of the protein Cas9. In this review, we present a detailed comparative analysis of pre-crRNA recognition and cleavage mechanisms involved in the biogenesis of guide crRNAs in the three CRISPR-Cas types.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 39, nr 3, s. 428-441
Nyckelord [en]
crRNA biogenesis, Cas5d, Cas6, Cas9, tracrRNA, RNase III
Nationell ämneskategori
Medicinsk bioteknologi (med inriktning mot cellbiologi (inklusive stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci) Medicinsk genetik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-106508DOI: 10.1093/femsre/fuv023ISI: 000355841200011OAI: oai:DiVA.org:umu-106508DiVA, id: diva2:841955
Tillgänglig från: 2015-07-15 Skapad: 2015-07-14 Senast uppdaterad: 2018-06-07Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2752 kB)255 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 2752 kBChecksumma SHA-512
1e2e8ded3eac2e232987e954b4b22f67810ce1d21dd6b9d10d2c044d88a9df54df3abc5cffb9c4a366ce81c8b9044fa80e8c3c07fc067769af3a9bd20aea4849
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Charpentier, Emmanuelle

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Charpentier, Emmanuelle
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Umeå Centre for Microbial Research (UCMR)Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
I samma tidskrift
FEMS Microbiology Reviews
Medicinsk bioteknologi (med inriktning mot cellbiologi (inklusive stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)Medicinsk genetik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 255 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 542 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf