umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Theory for nonlinear dynamic force spectroscopy
Swedish Defence Research Agency (FOI), Umeå, Sweden.ORCID-id: 0000-0001-7719-944X
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för fysik. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR). (The Biophysics and Biophotonics group)
2017 (Engelska)Ingår i: European Biophysics Journal, ISSN 0175-7571, E-ISSN 1432-1017, Vol. 46, nr 3, s. 225-233Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Dynamic force spectroscopy (DFS) is an experimental technique that is commonly used to assess information on the strength, energy landscape, and lifetime of noncovalent bio-molecular interactions. DFS traditionally requires an applied force that increases linearly with time so that the bio-complex under investigation is exposed to a constant loading rate. However, tethers or polymers can modulate the applied force in a nonlinear manner. For example, bacterial adhesion pili and polymers with worm-like chain properties are structures that show nonlinear force responses. In these situations, the theory for traditional DFS cannot be readily applied. In this work, we expand the theory for DFS to also include nonlinear external forces while still maintaining compatibility with the linear DFS theory. To validate the theory, we modeled a bio- complex expressed on a stiff, an elastic, and a worm-like chain polymer, using Monte Carlo methods, and assessed the corresponding rupture force spectra. It was found that the nonlinear DFS (NLDFS) theory correctly predicted the numerical results. We also present a protocol suggesting an experimental approach and analysis method of the data to estimate the bond length and the thermal off-rate.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2017. Vol. 46, nr 3, s. 225-233
Nyckelord [en]
AFM, Optical tweezers, Receptor, Ligand
Nationell ämneskategori
Annan fysik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-124645DOI: 10.1007/s00249-016-1158-6ISI: 000397496200002PubMedID: 27461369OAI: oai:DiVA.org:umu-124645DiVA, id: diva2:953886
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 2013-5379KempestiftelsernaTillgänglig från: 2016-08-19 Skapad: 2016-08-19 Senast uppdaterad: 2018-06-07Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1185 kB)101 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.pdfFilstorlek 1185 kBChecksumma SHA-512
19bca5fc561a25d1fecc1ac324947677b36522b538320005ef9afe641ca36b94842e9678f5fcc524795b5eec04120d85aabf71f0113d50a4b260dd8ddf6aa325
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Björnham, OscarAndersson, Magnus

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Björnham, OscarAndersson, Magnus
Av organisationen
Institutionen för fysikUmeå Centre for Microbial Research (UCMR)
I samma tidskrift
European Biophysics Journal
Annan fysik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 101 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 462 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf