umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Mediator binds to boundaries of chromosomal interaction domains and to proteins involved in DNA looping, RNA metabolism, chromatin remodeling, and actin assembly
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Visa övriga samt affilieringar
2017 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 45, nr 15, s. 8806-8821Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Mediator is a multi-unit molecular complex that plays a key role in transferring signals from transcriptional regulators to RNA polymerase II in eukaryotes. We have combined biochemical purification of the Sac-charomyces cerevisiae Mediator from chromatin with chromatin immunoprecipitation in order to reveal Mediator occupancy on DNA genome-wide, and to identify proteins interacting specifically with Mediator on the chromatin template. Tandem mass spectrometry of proteins in immunoprecipitates of mediator complexes revealed specific interactions between Mediator and the RSC, Arp2/Arp3, CPF, CF 1A and Lsm complexes in chromatin. These factors are primarily involved in chromatin remodeling, actin assembly, mRNA 3'-end processing, gene looping and mRNA decay, but they have also been shown to enter the nucleus and participate in Pol II transcription. Moreover, we have found that Mediator, in addition to binding Pol II promoters, occupies chromosomal interacting domain (CID) boundaries and that Mediator in chromatin associates with proteins that have been shown to interact with CID boundaries, such as Sth1, Ssu72 and histone H4. This suggests that Mediator plays a significant role in higher-order genome organization.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Oxford University Press, 2017. Vol. 45, nr 15, s. 8806-8821
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-139789DOI: 10.1093/nar/gkx491ISI: 000409380900020OAI: oai:DiVA.org:umu-139789DiVA, id: diva2:1146452
Tillgänglig från: 2017-10-03 Skapad: 2017-10-03 Senast uppdaterad: 2018-06-09Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(7456 kB)104 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 7456 kBChecksumma SHA-512
5690900109d1e01ffee33249e9a428b819314baa4d67496bd8fe81a50ebb3832866249f1b6ebd179b7bb1c92614ca32a88bae6690196098edd42ab83d160494e
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Elfving, NilsBlomberg, JeanetteLarsson, MiriamBjörklund, Stefan

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Elfving, NilsBlomberg, JeanetteLarsson, MiriamBjörklund, Stefan
Av organisationen
Institutionen för medicinsk kemi och biofysik
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 104 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 388 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf