umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Identification of susceptibility pathways for the role of chromosome 15q25.1 in modifying lung cancer risk
Visa övriga samt affilieringar
2018 (Engelska)Ingår i: Nature Communications, ISSN 2041-1723, E-ISSN 2041-1723, Vol. 9, s. 1-15, artikel-id 3221Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Genome-wide association studies (GWAS) identified the chromosome 15q25.1 locus as a leading susceptibility region for lung cancer. However, the pathogenic pathways, through which susceptibility SNPs within chromosome 15q25.1 affects lung cancer risk, have not been explored. We analyzed three cohorts with GWAS data consisting 42,901 individuals and lung expression quantitative trait loci (eQTL) data on 409 individuals to identify and validate the underlying pathways and to investigate the combined effect of genes from the identified susceptibility pathways. The KEGG neuroactive ligand receptor interaction pathway, two Reactome pathways, and 22 Gene Ontology terms were identified and replicated to be significantly associated with lung cancer risk, with P values less than 0.05 and FDR less than 0.1. Functional annotation of eQTL analysis results showed that the neuroactive ligand receptor interaction pathway and gated channel activity were involved in lung cancer risk. These pathways provide important insights for the etiology of lung cancer.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
NATURE PUBLISHING GROUP , 2018. Vol. 9, s. 1-15, artikel-id 3221
Nationell ämneskategori
Medicinsk genetik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-151046DOI: 10.1038/s41467-018-05074-yISI: 000441381200005PubMedID: 30104567Scopus ID: 2-s2.0-85051632965OAI: oai:DiVA.org:umu-151046DiVA, id: diva2:1245321
Tillgänglig från: 2018-09-05 Skapad: 2018-09-05 Senast uppdaterad: 2018-09-05Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2913 kB)39 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 2913 kBChecksumma SHA-512
b9d3731672124e0f74f0391c85f6c21803ba4c7abab893a39e1b4ff9ba48e3e170335fa988337a1daa8133a00aa47d8e7e0c6b31982bf1fcd4d33b452f5df9aa
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Personposter BETA

Grankvist, KjellJohansson, Mikael

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Bosse, YohanGrankvist, KjellJohansson, MikaelBolca, Ciprian
Av organisationen
Klinisk kemiOnkologi
I samma tidskrift
Nature Communications
Medicinsk genetik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 39 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 153 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf