umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Fine mapping of MHC region in lung cancer highlights independent susceptibility loci by ethnicity
Visa övriga samt affilieringar
2018 (Engelska)Ingår i: Nature Communications, ISSN 2041-1723, E-ISSN 2041-1723, Vol. 9, artikel-id 3927Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Lung cancer has several genetic associations identified within the major histocompatibility complex (MHC); although the basis for these associations remains elusive. Here, we analyze MHC genetic variation among 26,044 lung cancer patients and 20,836 controls densely genotyped across the MHC, using the Illumina Illumina OncoArray or Illumina 660W SNP microarray. We impute sequence variation in classical HLA genes, fine-map MHC associations for lung cancer risk with major histologies and compare results between ethnicities. Independent and novel associations within HLA genes are identified in Europeans including amino acids in the HLA-B*0801 peptide binding groove and an independent HLA-DQB1*06 loci group. In Asians, associations are driven by two independent HLA allele sets that both increase risk in HLA-DQB1*0401 and HLA-DRB1*0701; the latter better represented by the amino acid Ala-104. These results implicate several HLA-tumor peptide interactions as the major MHC factor modulating lung cancer susceptibility.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Nature Publishing Group, 2018. Vol. 9, artikel-id 3927
Nationell ämneskategori
Medicinsk genetik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-153722DOI: 10.1038/s41467-018-05890-2ISI: 000445562800006PubMedID: 30254314OAI: oai:DiVA.org:umu-153722DiVA, id: diva2:1266167
Forskningsfinansiär
NIH (National Institute of Health), CA092824NIH (National Institute of Health), CA090578NIH (National Institute of Health), CA074386NIH (National Institute of Health), CA164973NIH (National Institute of Health), CA033619NIH (National Institute of Health), CA63464NIH (National Institute of Health), CA148127Tillgänglig från: 2018-11-27 Skapad: 2018-11-27 Senast uppdaterad: 2020-04-08Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4137 kB)84 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4137 kBChecksumma SHA-512
1bc05d45c82512f451a7ede51c0568f93ce1582a083125bc03f8a0213cf1ad42e8c4205456cefa23a19ec84db2a1f05bd90a87a5dd7848b24940b243b0006418
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Johansson, MikaelGrankvist, Kjell

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Johansson, MattiasSwiatkowska, BeataRisch, AngelaJohansson, MikaelGrankvist, Kjell
Av organisationen
Institutionen för strålningsvetenskaperKlinisk kemi
I samma tidskrift
Nature Communications
Medicinsk genetik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 84 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 218 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf