umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Predicting mutational routes to new adaptive phenotypes
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet). New Zealand Institute for Advanced Study, Massey University at Albany, Auckland, New Zealand. (Peter Lind)ORCID-id: 0000-0003-1510-8324
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för matematik och matematisk statistik. New Zealand Institute for Advanced Study, Massey University at Albany, Auckland, New Zealand ; 3 Santa Fe Institute, New Mexico, United States. (Eric Libby)
2019 (Engelska)Ingår i: eLIFE, E-ISSN 2050-084X, Vol. 8, s. 1-31, artikel-id e38822Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Predicting evolutionary change poses numerous challenges. Here we take advantage of the model bacterium Pseudomonas fluorescens in which the genotype-to-phenotype map determining evolution of the adaptive ‘wrinkly spreader’ (WS) type is known. We present mathematical descriptions of three necessary regulatory pathways and use these to predict both the rate at which each mutational route is used and the expected mutational targets. To test predictions, mutation rates and targets were determined for each pathway. Unanticipated mutational hotspots caused experimental observations to depart from predictions but additional data led to refined models. A mismatch was observed between the spectra of WS-causing mutations obtained with and without selection due to low fitness of previously undetected WS-causing mutations. Our findings contribute toward the development of mechanistic models for forecasting evolution, highlight current limitations, and draw attention to challenges in predicting locus-specific mutational biases and fitness effects.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
eLife Sciences Publications , 2019. Vol. 8, s. 1-31, artikel-id e38822
Nyckelord [en]
evolutionary forecasting, pseudomonas, biofilm, genetics
Nationell ämneskategori
Evolutionsbiologi Mikrobiologi Annan matematik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-155079DOI: 10.7554/eLife.38822ISI: 000455079000001OAI: oai:DiVA.org:umu-155079DiVA, id: diva2:1276381
Tillgänglig från: 2019-01-08 Skapad: 2019-01-08 Senast uppdaterad: 2019-01-28Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1401 kB)103 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1401 kBChecksumma SHA-512
eb28c77e6c1fce9dd58ccc645c9a49145d95c7bb48e9073ba357d68932a7046a1be7ef34d0f66841476b0e92cc24742a7183193d2b6b4194195160d72d3f2279
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Lind, Peter ALibby, Eric

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Lind, Peter ALibby, Eric
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet)Institutionen för matematik och matematisk statistik
I samma tidskrift
eLIFE
EvolutionsbiologiMikrobiologiAnnan matematik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 103 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 292 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf