umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Landscape of the Plasmodium Interactome Reveals Both Conserved and Species-Specific Functionality
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: Cell reports, ISSN 2211-1247, E-ISSN 2211-1247, Vol. 28, nr 6, s. 1635-1647Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Malaria represents a major global health issue, and the identification of new intervention targets remains an urgent priority. This search is hampered by more than one-third of the genes of malaria-causing Plasmodium parasites being uncharacterized. We report a large-scale protein interaction network in Plasmodium schizonts, generated by combining blue native-polyacrylamide electrophoresis with quantitative mass spectrometry and machine learning. This integrative approach, spanning 3 species, identifies > 20,000 putative protein interactions, organized into 600 protein clusters. We validate selected interactions, assigning functions in chromatin regulation to previously unannotated proteins and suggesting a role for an EELM2 domain-containing protein and a putative microrchidia protein as mechanistic links between AP2-domain transcription factors and epigenetic regulation. Our interactome represents a high-confidence map of the native organization of core cellular processes in Plasmodium parasites. The network reveals putative functions for uncharacterized proteins, provides mechanistic and structural insight, and uncovers potential alternative therapeutic targets.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Elsevier, 2019. Vol. 28, nr 6, s. 1635-1647
Nyckelord [en]
Plasmodium, blue native-PAGE, interactome, protein-protein interactions, interaction network, malaria, Plasmodium falciparum, Plasmodium berghei, Plasmodium knowlesi
Nationell ämneskategori
Cellbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-162665DOI: 10.1016/j.celrep.2019.07.019ISI: 000478978200023PubMedID: 31390575OAI: oai:DiVA.org:umu-162665DiVA, id: diva2:1348524
Tillgänglig från: 2019-09-04 Skapad: 2019-09-04 Senast uppdaterad: 2019-09-04Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(10170 kB)106 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 10170 kBChecksumma SHA-512
4cd1d2a6615bbe7e1b550471a42769f515c65e49410cad35944e278dad79f64ad7f0cdbe41fd25fe90e7d6fc5facb9aebd0832409ee3d93bc9b7999dbef64698
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Bushell, EllenBillker, Oliver

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Bushell, EllenBillker, Oliver
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet)
I samma tidskrift
Cell reports
Cellbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 106 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 220 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf