umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Kluyveromyces lactis γ-toxin, a ribonuclease that recognizes the anticodon stem loop of tRNA
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet). (Byström)
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet). (Byström)
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet). (Byström)
2008 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 36, nr 4, s. 1072-1080Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Kluyveromyces lactis gamma-toxin is a tRNA endonuclease that cleaves Saccharomyces cerevisiae [see text] between position 34 and position 35. All three substrate tRNAs carry a 5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine (mcm(5)s(2)U) residue at position 34 (wobble position) of which the mcm(5) group is required for efficient cleavage. However, the different cleavage efficiencies of mcm(5)s(2)U(34)-containing tRNAs suggest that additional features of these tRNAs affect cleavage. In the present study, we show that a stable anticodon stem and the anticodon loop are the minimal requirements for cleavage by gamma-toxin. A synthetic minihelix RNA corresponding to the anticodon stem loop (ASL) of the natural substrate [see text] is cleaved at the same position as the natural substrate. In [see text], the nucleotides U(34)U(35)C(36)A(37)C(38) are required for optimal gamma-toxin cleavage, whereas a purine at position 32 or a G in position 33 dramatically reduces the cleavage of the ASL. Comparing modified and partially modified forms of E. coli and yeast [see text] reinforced the strong stimulatory effects of the mcm(5) group, revealed a weak positive effect of the s(2) group and a negative effect of the bacterial 5-methylaminomethyl (mnm(5)) group. The data underscore the high specificity of this yeast tRNA toxin.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2008. Vol. 36, nr 4, s. 1072-1080
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-20534DOI: 10.1093/nar/gkm1121PubMedID: 18096622OAI: oai:DiVA.org:umu-20534DiVA, id: diva2:208858
Tillgänglig från: 2009-03-20 Skapad: 2009-03-20 Senast uppdaterad: 2018-06-09

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Esberg, AndersByström, Anders S

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Esberg, AndersByström, Anders S
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet)
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
Medicin och hälsovetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 196 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf