umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The Norway spruce genome sequence and conifer genome evolution
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för fysiologisk botanik. Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Umeå Plant Science Centre (UPSC).ORCID-id: 0000-0001-6031-005X
Visa övriga samt affilieringar
2013 (Engelska)Ingår i: Nature, ISSN 0028-0836, E-ISSN 1476-4687, Vol. 497, nr 7451, 579-584 s.Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Conifers have dominated forests for more than 200 million years and are of huge ecological and economic importance. Here we present the draft assembly of the 20-gigabase genome of Norway spruce (Picea abies), the first available for any gymnosperm. The number of well-supported genes (28,354) is similar to the >100 times smaller genome of Arabidopsis thaliana, and there is no evidence of a recent whole-genome duplication in the gymnosperm lineage. Instead, the large genome size seems to result from the slow and steady accumulation of a diverse set of long-terminal repeat transposable elements, possibly owing to the lack of an efficient elimination mechanism. Comparative sequencing of Pinus sylvestris, Abies sibirica, Juniperus communis, Taxus baccata and Gnetum gnemon reveals that the transposable element diversity is shared among extant conifers. Expression of 24-nucleotide small RNAs, previously implicated in transposable element silencing, is tissue-specific and much lower than in other plants. We further identify numerous long (>10,000 base pairs) introns, gene-like fragments, uncharacterized long non-coding RNAs and short RNAs. This opens up new genomic avenues for conifer forestry and breeding.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Nature Publishing Group, 2013. Vol. 497, nr 7451, 579-584 s.
Nationell ämneskategori
Geovetenskap och miljövetenskap Botanik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-76264DOI: 10.1038/nature12211ISI: 000319556100035OAI: oai:DiVA.org:umu-76264DiVA: diva2:635995
Tillgänglig från: 2013-07-08 Skapad: 2013-07-08 Senast uppdaterad: 2017-12-06Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Street, Nathaniel RobertScofield, Douglas G.Delhomme, NicolasKeech, OlivierTuominen, HanneleWu, Zhi-QiangZhang, BoHvidsten, Torgeir R.Thompson, Stacey LeeIngvarsson, Pär K.Jansson, Stefan
Av organisationen
Institutionen för fysiologisk botanikUmeå Plant Science Centre (UPSC)Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap
I samma tidskrift
Nature
Geovetenskap och miljövetenskapBotanik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 533 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf