umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Detection and Isolation of Sindbis Virus from Mosquitoes Captured During an Outbreak in Sweden, 2013
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biovetenskap.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi.
Visa övriga samt affilieringar
2015 (Engelska)Ingår i: Vector Borne and Zoonotic Diseases, ISSN 1530-3667, E-ISSN 1557-7759, Vol. 15, nr 2, s. 133-140Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Mosquito-borne alphaviruses have the potential to cause large outbreaks throughout the world. Here we investigated the causative agent of an unexpected Sindbis virus (SINV) outbreak during August-September, 2013, in a previously nonendemic region of Sweden. Mosquitoes were collected using carbon dioxide-baited CDC traps at locations close to human cases. The mosquitoes were initially screened as large pools by SINV-specific quantitative RT-PCR, and the SINV-positive mosquitoes were species determined by single-nucleotide polymorphism (SNP) analysis, followed by sequencing the barcoding region of the cytochrome oxidase I gene. The proportion of the collected mosquitoes was determined by a metabarcoding strategy. By using novel strategies for PCR screening and genetic typing, a new SINV strain, Lovanger, was isolated from a pool of 1600 mosquitoes composed of Culex, Culiseta, and Aedes mosquitoes as determined by metabarcoding. The SINV-positive mosquito Culiseta morsitans was identified by SNP analysis and sequencing. After whole-genome sequencing and phylogenetic analysis, the SINV Lovanger isolate was shown to be most closely similar to recent Finnish SINV isolates. In conclusion, within a few weeks, we were able to detect and isolate a novel SINV strain and identify the mosquito vector during a sudden SINV outbreak.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 15, nr 2, s. 133-140
Nyckelord [en]
Barcoding, Mosquito, Isolation, Virus, Sindbis
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-100963DOI: 10.1089/vbz.2014.1717ISI: 000349682500007PubMedID: 25700044OAI: oai:DiVA.org:umu-100963DiVA, id: diva2:796170
Tillgänglig från: 2015-03-18 Skapad: 2015-03-16 Senast uppdaterad: 2018-06-07Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(560 kB)399 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 560 kBChecksumma SHA-512
1efa0201f7f24183d9e7fa329bb2ef2aae90a93b6e2018ed54dd999a314128b9ba00bf67b97a0825d56ce75e78f4507254c98d810cde5b3c165d1ceb7e657be8
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Larsson, PärNäslund, JonasEngdahl, CeciliaGylfe, ÅsaAhlm, ClasEvander, Magnus

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Larsson, PärNäslund, JonasEngdahl, CeciliaGylfe, ÅsaAhlm, ClasEvander, Magnus
Av organisationen
Institutionen för klinisk mikrobiologiInstitutionen för medicinsk biovetenskapKemiska institutionenArktiskt centrum vid Umeå universitet (Arcum)
I samma tidskrift
Vector Borne and Zoonotic Diseases
Medicin och hälsovetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 399 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 858 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf