Umeå University's logo

umu.sePublikasjoner
Endre søk
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A light-triggered time-resolved x-ray solution scattering (tr-xss) workflow with application to protein conformational dynamics
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.ORCID-id: 0000-0002-0706-7414
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.ORCID-id: 0000-0002-3364-6647
2026 (engelsk)Inngår i: FEBS Open Bio, E-ISSN 2211-5463Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Epub ahead of print
Abstract [en]

Time-resolved X-ray solution scattering (TR-XSS) is a synchrotron-based methodology that enables real-time structural characterization under near-native conditions to provide insight into dynamic and transient structural changes inaccessible to static high-resolution methods such as cryo-electron microscopy (cryo-EM) or X-ray crystallography. Here, we present a workflow for light-triggered TR-XSS experiments that spans data collection, data processing, kinetic analysis, and structural refinement, with accompanying Python scripts. A calcium-transporting P-type ATPase membrane protein (LMCA1) is used as an illustrative example, but the protocol is broadly applicable to diverse protein systems. This workflow offers a practical framework for collecting TR-XSS synchrotron data and subsequent data analysis and interpretation.

sted, utgiver, år, opplag, sider
John Wiley & Sons, 2026.
Emneord [en]
kinetic modeling, protein conformational dynamics, structural refinement, time-resolved X-ray solution scattering (TR-XSS)
HSV kategori
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-250064DOI: 10.1002/2211-5463.70200PubMedID: 41669764Scopus ID: 2-s2.0-105029833005OAI: oai:DiVA.org:umu-250064DiVA, id: diva2:2041832
Forskningsfinansiär
EU, Horizon 2020, 101081419Swedish Research Council, 2024-04385The Kempe Foundations, JCSMK 24-543Tilgjengelig fra: 2026-02-26 Laget: 2026-02-26 Sist oppdatert: 2026-02-26

Open Access i DiVA

fulltext(1558 kB)57 nedlastinger
Filinformasjon
Fil FULLTEXT01.pdfFilstørrelse 1558 kBChecksum SHA-512
8c292cfdb20a9d08b4cb5bcb122945083838ffc158c65d53835313af45dfea81b346875f847e054ab385d5c78b80a0b3510432dd8409dd5b9b594afa2e12c6fd
Type fulltextMimetype application/pdf

Andre lenker

Forlagets fulltekstPubMedScopus

Person

Sabzian-Molaei, FatemehOrädd, FredrikMagkakis, KonstantinosAndersson, Magnus

Søk i DiVA

Av forfatter/redaktør
Sabzian-Molaei, FatemehOrädd, FredrikMagkakis, KonstantinosAndersson, Magnus
Av organisasjonen
I samme tidsskrift
FEBS Open Bio

Søk utenfor DiVA

GoogleGoogle Scholar
Antall nedlastinger er summen av alle nedlastinger av alle fulltekster. Det kan for eksempel være tidligere versjoner som er ikke lenger tilgjengelige

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetric

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 1976 treff
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf