Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A thumb-domain insertion balances processivity and fidelity in DNA polymerase ε
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.ORCID-id: 0000-0002-8526-6224
2026 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 54, nr 6, artikel-id gkag282Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Recent cryo-EM structures of human DNA polymerase ε (Pol ε) bound to PCNA position a Pol ε-specific thumb insertion (polymerase thumb insertion; PTI) adjacent to a PCNA protomer, suggesting a regulatory role in DNA synthesis. To define the functional contribution of this region, we generated alanine-substitution variants in the yeast Pol ε thumb domain, targeting the PTI (SLED1131–1134→AAAA; polε-SLED) and an adjacent conserved loop (PVTE1101–1104→AAAA; polε-PVTE and KPFN1096–1099→AAAA; polε-KPFN). polε-SLED displayed increased intrinsic processivity, efficient bypass of DNA secondary structures, and enhanced synthesis on long templates, consistent with reduced pausing. In contrast, a previous study extended this substitution to six amino acids, SLEDLD1131-1136→AAAAAA, and found a reversed effect, a reduced processivity, indicating that subtle perturbations in this insertion can have opposing functional consequences. polε-PVTE shifted polymerase activity toward exonuclease proofreading and was not fully rescued by PCNA on long templates, whereas polε-KPFN retained near–wild-type activity but showed increased sensitivity to secondary structures that was alleviated by PCNA. In vivo, the corresponding pol2-SLED allele caused a modest mutator phenotype, while pol2-PVTE and pol2-KPFN showed little or no increase. Together, these results indicate that the PTI fine-tunes intrinsic processivity and proofreading to maintain replication fidelity during leading-strand synthesis.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Oxford University Press, 2026. Vol. 54, nr 6, artikel-id gkag282
Nationell ämneskategori
Biokemi Molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-252213DOI: 10.1093/nar/gkag282ISI: 001729295100001PubMedID: 41914498Scopus ID: 2-s2.0-105034704467OAI: oai:DiVA.org:umu-252213DiVA, id: diva2:2055240
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 2021-01 104Cancerfonden, 25 4829 PjTillgänglig från: 2026-04-23 Skapad: 2026-04-23 Senast uppdaterad: 2026-04-23Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4034 kB)59 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4034 kBChecksumma SHA-512
99193bdfa1c7cac9376a77e2d6e388f38a7d00386a1e8f137e359b205131efec59381ea67609b78eecf6f64e66247e9833e6bf7a519ccaf5b7aef9f2f4ff689b
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Singh, NoopurBylund, GöranJohansson, Erik

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Singh, NoopurBylund, GöranJohansson, Erik
Av organisationen
Institutionen för medicinsk kemi och biofysik
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
BiokemiMolekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 207 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf