Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Structure of the 30S ribosomal decoding complex at ambient temperature
Visa övriga samt affilieringar
2018 (Engelska)Ingår i: RNA: A publication of the RNA Society, ISSN 1355-8382, E-ISSN 1469-9001, Vol. 24, nr 12, s. 1667-1676Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The ribosome translates nucleotide sequences of messenger RNA to proteins through selection of cognate transfer RNA according to the genetic code. To date, structural studies of ribosomal decoding complexes yielding high-resolution data have predominantly relied on experiments performed at cryogenic temperatures. New light sources like the X-ray free electron laser (XFEL) have enabled data collection from macromolecular crystals at ambient temperature. Here, we report an X-ray crystal structure of the Therm us thermophilus 30S ribosomal subunit decoding complex to 3.45 angstrom resolution using data obtained at ambient temperature at the Linac Coherent Light Source (LCLS). We find that this ambient-temperature structure is largely consistent with existing cryogenic-temperature crystal structures, with key residues of the decoding complex exhibiting similar conformations, including adenosine residues 1492 and 1493. Minor variations were observed, namely an alternate conformation of cytosine 1397 near the mRNA channel and the A-site. Our serial crystallography experiment illustrates the amenability of ribosomal microcrystals to routine structural studies at ambient temperature, thus overcoming a long-standing experimental limitation to structural studies of RNA and RNA-protein complexes at near-physiological temperatures.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Cold Spring Harbor Laboratory Press (CSHL), 2018. Vol. 24, nr 12, s. 1667-1676
Nyckelord [en]
serial femtosecond X-ray crystallography, ribosome, decoding, ambient temperature, antibiotics
Nationell ämneskategori
Strukturbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-154036DOI: 10.1261/rna.067660.118ISI: 000450373800006PubMedID: 30139800Scopus ID: 2-s2.0-85056573149OAI: oai:DiVA.org:umu-154036DiVA, id: diva2:1272827
Forskningsfinansiär
KempestiftelsernaTillgänglig från: 2018-12-20 Skapad: 2018-12-20 Senast uppdaterad: 2023-03-24Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(3332 kB)225 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 3332 kBChecksumma SHA-512
2ae014c709ef35e29f5f0e288eabba9b6f251097d30de356093dd310dcc38bb580a1882f65bbc1d922297b1826393be2945159c10492fb166bb10044b3fadfee
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

de Lichtenberg, Casper

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
de Lichtenberg, Casper
Av organisationen
Kemiska institutionen
I samma tidskrift
RNA: A publication of the RNA Society
Strukturbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 225 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 299 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf