Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Lake sedimentary dna research on past terrestrial and aquatic biodiversity: Overview and recommendations
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap. Department of Marine Biology, Institut de Ciències del Mar, CSIC, Barcelona, Spain.ORCID-id: 0000-0001-9143-7061
Department Environment, Dynamics and Territories of the Mountains (EDYTEM), UMR 5204, CNRS, University Savoie Mont Blanc, Le Bourget du Lac, France.
Department of Geosciences, UiT the Arctic University of Norway, Tromsø, Norway; Section for Geogenetics, GLOBE Institute, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark.
Department of Ecology and Genetics, the Evolutionary Biology Centre, Uppsala University, Uppsala, Sweden.
Visa övriga samt affilieringar
2021 (Engelska)Ingår i: Quaternary, E-ISSN 2571-550X, Vol. 4, nr 1, artikel-id 6Artikel, forskningsöversikt (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The use of lake sedimentary DNA to track the long-term changes in both terrestrial and aquatic biota is a rapidly advancing field in paleoecological research. Although largely applied nowadays, knowledge gaps remain in this field and there is therefore still research to be conducted to ensure the reliability of the sedimentary DNA signal. Building on the most recent literature and seven original case studies, we synthesize the state-of-the-art analytical procedures for effective sampling, extraction, amplification, quantification and/or generation of DNA inventories from sedimentary ancient DNA (sedaDNA) via high-throughput sequencing technologies. We provide recommendations based on current knowledge and best practises.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
MDPI, 2021. Vol. 4, nr 1, artikel-id 6
Nyckelord [en]
Biodiversity, Lake sediments, Metabarcoding, Metagenomics, Paleoecology, Paleogenetics, Paleogenomics, Paleolimnology, Sedimentary ancient DNA, Sedimentary DNA
Nationell ämneskategori
Geokemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-182945DOI: 10.3390/quat4010006ISI: 000633093700001Scopus ID: 2-s2.0-85104594727OAI: oai:DiVA.org:umu-182945DiVA, id: diva2:1553831
Tillgänglig från: 2021-05-11 Skapad: 2021-05-11 Senast uppdaterad: 2024-02-13Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(6049 kB)138 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 6049 kBChecksumma SHA-512
96650746233ffcbdb159bf2218b90a8e208d632061e3e399465f3994694d36153d3488b91c397e81842730854df3e33e8086911ff6b8b2050d2e57f766de532d
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Person

Capo, EricBigler, ChristianBindler, RichardOlajos, FredrikRydberg, Johanvan Woerkom, Anne

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Capo, EricRouillard, AlexandraBigler, ChristianBindler, RichardEnglund, GöranOlajos, FredrikRydberg, Johanvan Woerkom, Anne
Av organisationen
Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap
I samma tidskrift
Quaternary
Geokemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 139 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 817 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf