Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The integrity and assay performance of tissue mitochondrial DNA is considerably affected by choice of isolation method
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.ORCID-id: 0000-0001-5704-3093
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Visa övriga samt affilieringar
2021 (Engelska)Ingår i: Mitochondrion (Amsterdam. Print), ISSN 1567-7249, E-ISSN 1872-8278, Vol. 61, s. 179-187Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The integrity of mitochondrial DNA (mtDNA) isolated from solid tissues is critical for analyses such as long-range PCR, but is typically assessed under conditions that fail to provide information on the individual mtDNA strands. Using denaturing gel electrophoresis, we show that commonly-used isolation procedures generate mtDNA containing several single-strand breaks per strand. Through systematic comparison of DNA isolation methods, we identify a procedure yielding the highest integrity of mtDNA that we demonstrate displays improved performance in downstream assays. Our results highlight the importance of isolation method choice, and serve as a resource to researchers requiring high-quality mtDNA from solid tissues.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Elsevier, 2021. Vol. 61, s. 179-187
Nyckelord [en]
DNA integrity, Long-range PCR, Mitochondrial DNA, mtDNA, Nuclease activity
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-189552DOI: 10.1016/j.mito.2021.10.005ISI: 000717836700001Scopus ID: 2-s2.0-85118478892OAI: oai:DiVA.org:umu-189552DiVA, id: diva2:1611754
Forskningsfinansiär
Åke Wibergs Stiftelse, M20-0132Cancerfonden, 19 0022 JIA, 190098 Pj 01 HSvenska Sällskapet för Medicinsk Forskning (SSMF), S17-0023Vetenskapsrådet, 2019-01874Tillgänglig från: 2021-11-16 Skapad: 2021-11-16 Senast uppdaterad: 2023-09-05Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(3471 kB)196 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 3471 kBChecksumma SHA-512
43547d19c0e0f7c4e1b4e24c6453aac511294791645d00a979b3967aaa3903f0016508593c96da9b8f73b48e2e9f783a6f80429cf0f7abbcf1bb2defca858386
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Person

Repolês, Bruno MarçalGorospe, Choco MichaelTran, PhongNilsson, Anna KarinWanrooij, Paulina H.

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Repolês, Bruno MarçalGorospe, Choco MichaelTran, PhongNilsson, Anna KarinWanrooij, Paulina H.
Av organisationen
Institutionen för medicinsk kemi och biofysik
I samma tidskrift
Mitochondrion (Amsterdam. Print)
Cell- och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 196 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 287 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf