Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
m6A RNA immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing to map N6-Methyladenosine
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten).ORCID-id: 0000-0002-2374-2045
2022 (Engelska)Ingår i: Post-transcriptional gene regulation / [ed] Erik Dassi, Humana Press, 2022, 3, , s. 8s. 355-362Kapitel i bok, del av antologi (Refereegranskat)
Abstract [en]

N6-methyladenosine (m6A) is the most abundant internal modification on messenger RNAs (mRNAs) and long noncoding RNAs (lncRNAs) in eukaryotes. It influences gene expression by regulating RNA processing, nuclear export, mRNA decay, and translation. Hence, m6A controls fundamental cellular processes, and dysregulated deposition of m6A has been acknowledged to play a role in a broad range of human diseases, including cancer. m6A RNA immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing (MeRIP-seq or m6A-seq) is a powerful technique to map m6A in a transcriptome-wide level. After immunoprecipitation of fragmented polyadenylated (poly(A)+) rich RNA by using specific anti-m6A antibodies, both the immunoprecipitated RNA fragments together with the input control are subjected to massively parallel sequencing. The generation of such comprehensive methylation profiles of signal enrichment relative to input control is necessary in order to better comprehend the pathogenesis behind aberrant m6A deposition.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Humana Press, 2022, 3. , s. 8s. 355-362
Serie
Methods in Molecular Biology (MIMB), ISSN 1064-3745, E-ISSN 1940-6029 ; 2404
Nyckelord [en]
Epitranscriptomics, MeRIP-seq or m6A-seq, METTL3, N6-Methyladenosine
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-189549DOI: 10.1007/978-1-0716-1851-6_19Scopus ID: 2-s2.0-85118431040ISBN: 9781071618516 (digital)ISBN: 9781071618509 (tryckt)OAI: oai:DiVA.org:umu-189549DiVA, id: diva2:1611768
Forskningsfinansiär
Region VästerbottenKnut och Alice Wallenbergs StiftelseVetenskapsrådet, 2017-01636Kempestiftelserna, 19 0337 Pj, SMK-1766Tillgänglig från: 2021-11-16 Skapad: 2021-11-16 Senast uppdaterad: 2022-03-08Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Person

Bhattarai, Devi PrasadAguilo, Francesca

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Bhattarai, Devi PrasadAguilo, Francesca
Av organisationen
Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM)Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)
Cell- och molekylärbiologiBiokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
isbn
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
isbn
urn-nbn
Totalt: 395 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf