Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A complementary chemical probe approach towards customized studies of G-quadruplex DNA structures in live cells
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.ORCID-id: 0000-0001-8089-2333
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Visa övriga samt affilieringar
2022 (Engelska)Ingår i: Chemical Science, ISSN 2041-6520, E-ISSN 2041-6539, Vol. 13, nr 8, s. 2347-2354Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

G-quadruplex (G4) DNA structures are implicated in central biological processes and are considered promising therapeutic targets because of their links to human diseases such as cancer. However, functional details of how, when, and why G4 DNA structures form in vivo are largely missing leaving a knowledge gap that requires tailored chemical biology studies in relevant live-cell model systems. Towards this end, we developed a synthetic platform to generate complementary chemical probes centered around one of the most effective and selective G4 stabilizing compounds, Phen-DC3. We used a structure-based design and substantial synthetic devlopments to equip Phen-DC3 with an amine in a position that does not interfere with G4 interactions. We next used this reactive handle to conjugate a BODIPY fluorophore to Phen-DC3. This generated a fluorescent derivative with retained G4 selectivity, G4 stabilization, and cellular effect that revealed the localization and function of Phen-DC3 in human cells. To increase cellular uptake, a second chemical probe with a conjugated cell-penetrating peptide was prepared using the same amine-substituted Phen-DC3 derivative. The cell-penetrating peptide conjugation, while retaining G4 selectivity and stabilization, increased nuclear localization and cellular effects, showcasing the potential of this method to modulate and direct cellular uptake e.g. as delivery vehicles. The applied approach to generate multiple tailored biochemical tools based on the same core structure can thus be used to advance the studies of G4 biology to uncover molecular details and therapeutic approaches. This journal is

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Royal Society of Chemistry, 2022. Vol. 13, nr 8, s. 2347-2354
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-193064DOI: 10.1039/d1sc05816aISI: 000751956900001Scopus ID: 2-s2.0-85125772577OAI: oai:DiVA.org:umu-193064DiVA, id: diva2:1646239
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, VR-NT 2017-05235Kempestiftelserna, SMK-1632Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse, VR-MH 2018-0278EU, Horisont 2020, 751474Tillgänglig från: 2022-03-21 Skapad: 2022-03-21 Senast uppdaterad: 2023-03-24Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(847 kB)148 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 847 kBChecksumma SHA-512
8397999b52cdc461361878bd5bffb493fa060c3e4ae5f1e56abf523b3cc0fedc4ca2828b531233bdb350b73bba3d577ac78bbcc8997b7f3f7e24dea3159e4f26
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Person

Prasad, BagineniDoimo, MaraAndréasson, MånsL'Hôte, ValentinChorell, ErikWanrooij, Sjoerd

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Prasad, BagineniDoimo, MaraAndréasson, MånsL'Hôte, ValentinChorell, ErikWanrooij, Sjoerd
Av organisationen
Kemiska institutionenInstitutionen för medicinsk kemi och biofysik
I samma tidskrift
Chemical Science
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 148 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 781 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf