Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Single-cell RNA-seq reveals hidden transcriptional variation in malaria parasites
Visa övriga samt affilieringar
2018 (Engelska)Ingår i: eLIFE, E-ISSN 2050-084X, Vol. 7, artikel-id e33105Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Single-cell RNA-sequencing is revolutionising our understanding of seemingly homogeneous cell populations but has not yet been widely applied to single-celled organisms. Transcriptional variation in unicellular malaria parasites from the Plasmodium genus is associated with critical phenotypes including red blood cell invasion and immune evasion, yet transcriptional variation at an individual parasite level has not been examined in depth. Here, we describe the adaptation of a single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) protocol to deconvolute transcriptional variation for more than 500 individual parasites of both rodent and human malaria comprising asexual and sexual life-cycle stages. We uncover previously hidden discrete transcriptional signatures during the pathogenic part of the life cycle, suggesting that expression over development is not as continuous as commonly thought. In transmission stages, we find novel, sex-specific roles for differential expression of contingency gene families that are usually associated with immune evasion and pathogenesis.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
eLife Sciences Publications, Ltd , 2018. Vol. 7, artikel-id e33105
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-165832DOI: 10.7554/eLife.33105ISI: 000428405500001PubMedID: 29580379OAI: oai:DiVA.org:umu-165832DiVA, id: diva2:1379071
Forskningsfinansiär
Wellcome trust, WT098051Tillgänglig från: 2019-12-16 Skapad: 2019-12-16 Senast uppdaterad: 2019-12-18Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4114 kB)150 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4114 kBChecksumma SHA-512
5bd25477470ed52a7472e5485aff871de93586134b96122c0b0e7b871d95f15992b29ea6e64fea2f5fb833aee613a3a8de22c4c1bab8e777093ffb349b465d48
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Person

Billker, Oliver

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Billker, Oliver
I samma tidskrift
eLIFE
Cell- och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 150 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 198 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf