Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
PlasmoGEM, a database supporting a community resource for large-scale experimental genetics in malaria parasites
Visa övriga samt affilieringar
2015 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 43, nr Database issue, s. D1176-D1182Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The Plasmodium Genetic Modification (PlasmoGEM) database (http://plasmogem.sanger.ac.uk) provides access to a resource of modular, versatile and adaptable vectors for genome modification of Plasmodium spp. parasites. PlasmoGEM currently consists of >2000 plasmids designed to modify the genome of Plasmodium berghei, a malaria parasite of rodents, which can be requested by non-profit research organisations free of charge. PlasmoGEM vectors are designed with long homology arms for efficient genome integration and carry gene specific barcodes to identify individual mutants. They can be used for a wide array of applications, including protein localisation, gene interaction studies and high-throughput genetic screens. The vector production pipeline is supported by a custom software suite that automates both the vector design process and quality control by full-length sequencing of the finished vectors. The PlasmoGEM web interface allows users to search a database of finished knock-out and gene tagging vectors, view details of their designs, download vector sequence in different formats and view available quality control data as well as suggested genotyping strategies. We also make gDNA library clones and intermediate vectors available for researchers to produce vectors for themselves.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Oxford University Press, 2015. Vol. 43, nr Database issue, s. D1176-D1182
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-165854DOI: 10.1093/nar/gku1143ISI: 000350210400172PubMedID: 25593348OAI: oai:DiVA.org:umu-165854DiVA, id: diva2:1379087
Forskningsfinansiär
Wellcome trust, 089085/Z/09/ZTillgänglig från: 2019-12-16 Skapad: 2019-12-16 Senast uppdaterad: 2019-12-18Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4036 kB)156 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4036 kBChecksumma SHA-512
5761a5b9a48dbd4a60ef82d6f35a22b65af805d6f7ddba858ffbeddb817c928cff74ccab4c02e010d38b7135c0b7dcfe7b1a73bbd5d3f40c4531d86dff1a5118
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Person

Billker, Oliver

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Billker, Oliver
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
Cell- och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 156 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 228 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf