Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A genome-scale vector resource enables high-throughput reverse genetic screening in a malaria parasite
Visa övriga samt affilieringar
2015 (Engelska)Ingår i: Cell Host and Microbe, ISSN 1931-3128, E-ISSN 1934-6069, Vol. 17, nr 3, s. 404-413Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The genome-wide identification of gene functions in malaria parasites is hampered by a lack of reverse genetic screening methods. We present a large-scale resource of barcoded vectors with long homology arms for effective modification of the Plasmodium berghei genome. Cotransfecting dozens of vectors into the haploid blood stages creates complex pools of barcoded mutants, whose competitive fitness can be measured during infection of a single mouse using barcode sequencing (barseq). To validate the utility of this resource, we rescreen the P. berghei kinome, using published kinome screens for comparison. We find that several protein kinases function redundantly in asexual blood stages and confirm the targetability of kinases cdpk1, gsk3, tkl3, and PBANKA_082960 by genotyping cloned mutants. Thus, parallel phenotyping of barcoded mutants unlocks the power of reverse genetic screening for a malaria parasite and will enable the systematic identification of genes essential for in vivo parasite growth and transmission.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Cell Press , 2015. Vol. 17, nr 3, s. 404-413
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-165853DOI: 10.1016/j.chom.2015.01.014ISI: 000350979800019PubMedID: 25732065OAI: oai:DiVA.org:umu-165853DiVA, id: diva2:1379092
Forskningsfinansiär
Wellcome trust, 098051Tillgänglig från: 2019-12-16 Skapad: 2019-12-16 Senast uppdaterad: 2019-12-18Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(5023 kB)296 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 5023 kBChecksumma SHA-512
4d2596cd74ec886fe413de6e634ff4bc68c269c0f8cff89639d83f882658bb18eeeaa7a4cf5b7f9a422cbd0fb74d6ab34c7c540a7828d3dad0b0d589a36a46fd
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Person

Billker, Oliver

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Billker, Oliver
I samma tidskrift
Cell Host and Microbe
Cell- och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 296 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 355 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf