Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Chromosome-level genome assembly of a parent species of widely cultivated azaleas
Visa övriga samt affilieringar
2020 (Engelska)Ingår i: Nature Communications, E-ISSN 2041-1723, Vol. 11, nr 1, artikel-id 5269Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Azaleas (Ericaceae) comprise one of the most diverse ornamental plants, renowned for their cultural and economic importance. We present a chromosome-scale genome assembly for Rhododendron simsii, the primary ancestor of azalea cultivars. Genome analyses unveil the remnants of an ancient whole-genome duplication preceding the radiation of most Ericaceae, likely contributing to the genomic architecture of flowering time. Small-scale gene duplications contribute to the expansion of gene families involved in azalea pigment biosynthesis. We reconstruct entire metabolic pathways for anthocyanins and carotenoids and their potential regulatory networks by detailed analysis of time-ordered gene co-expression networks. MYB, bHLH, and WD40 transcription factors may collectively regulate anthocyanin accumulation in R. simsii, particularly at the initial stages of flower coloration, and with WRKY transcription factors controlling progressive flower coloring at later stages. This work provides a cornerstone for understanding the underlying genetics governing flower timing and coloration and could accelerate selective breeding in azalea. Azaleas are one of the most diverse ornamental plants and have cultural and economic importance. Here, the authors report a chromosome-scale genome assembly for the primary ancestor of the azalea cultivar Rhododendro simsi and identify transcription factors that may function in flower coloration at different stages.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Nature Publishing Group, 2020. Vol. 11, nr 1, artikel-id 5269
Nationell ämneskategori
Genetik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-176910DOI: 10.1038/s41467-020-18771-4ISI: 000585918500004PubMedID: 33077749Scopus ID: 2-s2.0-85092780912OAI: oai:DiVA.org:umu-176910DiVA, id: diva2:1502576
Tillgänglig från: 2020-11-20 Skapad: 2020-11-20 Senast uppdaterad: 2023-03-28Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4372 kB)159 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4372 kBChecksumma SHA-512
683eb9b7a7ca68ae454e834d545850cd64105a9e7f046a4a9fc7ec9feb62609cb59e968ee20306bed15f37c21d4d9df11f3bb5cfc9259b3217cd37bca3c7ec2a
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Zhao, WeiMannapperuma, ChanakaStreet, NathanielWang, Xiao-Ru

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Zhao, WeiMannapperuma, ChanakaStreet, NathanielWang, Xiao-Ru
Av organisationen
Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskapUmeå Plant Science Centre (UPSC)Institutionen för fysiologisk botanik
I samma tidskrift
Nature Communications
Genetik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 159 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 293 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf