Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The etiological agent of Lyme disease, Borrelia burgdorferi, appears to contain
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). (Bergström)
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). (Bergström)
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). (Bergström)
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). (Johansson)
2004 (Engelska)Ingår i: Journal of Bacteriology, ISSN 0021-9193, E-ISSN 1098-5530, Vol. 186, nr 24, s. 8472-8477Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Small regulatory RNAs (sRNAs) have recently been shown to be the main controllers of several regulatory pathways. The function of sRNAs depends in many cases on the RNA-binding protein Hfq, especially for sRNAs with an antisense function. In this study, the genome of Borrelia burgdorferi was subjected to different searches for sRNAs, including direct homology and comparative genomics searches and ortholog- and annotation-based search strategies. Two new sRNAs were found, one of which showed complementarity to the rpoS region, which it possibly controls by an antisense mechanism. The role of the other sRNA is unknown, although observed complementarities against particular mRNA sequences suggest an antisense mechanism. We suggest that the low level of sRNAs observed in B. burgdorferi is at least partly due to the presumed lack of both functional Hfq protein and RNase E activity.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2004. Vol. 186, nr 24, s. 8472-8477
Nyckelord [en]
Animals, Borrelia burgdorferi/*genetics, Computational Biology/methods, Endoribonucleases, Genome; Bacterial, Genomics, Host Factor 1 Protein, Humans, Lyme Disease/*microbiology, MicroRNAs/*genetics, RNA; Bacterial/*genetics, Rabbits
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-12945PubMedID: 15576797Scopus ID: 2-s2.0-10044298389OAI: oai:DiVA.org:umu-12945DiVA, id: diva2:152616
Tillgänglig från: 2007-10-03 Skapad: 2007-10-03 Senast uppdaterad: 2023-03-24Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

PubMedScopushttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Retrieve&list_uids=15576797&dopt=Citation

Person

Östberg, YngveBunikis, IgnasBergström, SvenJohansson, Jörgen

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Östberg, YngveBunikis, IgnasBergström, SvenJohansson, Jörgen
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)
I samma tidskrift
Journal of Bacteriology
Cell- och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

pubmed
urn-nbn
Totalt: 418 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf