Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Landscape setting drives the microbial eukaryotic community structure in four Swedish mountain lakes over the holocene
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap. Department of Marine Biology, Institut de Ciències del Mar, CSIC, Barcelona, Spain.ORCID-id: 0000-0001-9143-7061
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap.
INRAE, UMR CARRTEL, Université Savoie Mont Blanc, Thonon les Bains, France.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap. (Arcum)
Visa övriga samt affilieringar
2021 (Engelska)Ingår i: Microorganisms, E-ISSN 2076-2607, Vol. 9, nr 2, artikel-id 355Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

On the annual and interannual scales, lake microbial communities are known to be heavily influenced by environmental conditions both in the lake and in its terrestrial surroundings. How-ever, the influence of landscape setting and environmental change on shaping these communities over a longer (millennial) timescale is rarely studied. Here, we applied an 18S metabarcoding approach to DNA preserved in Holocene sediment records from two pairs of co‐located Swedish mountain lakes. Our data revealed that the microbial eukaryotic communities were strongly influenced by catchment characteristics rather than location. More precisely, the microbial communities from the two bedrock lakes were largely dominated by unclassified Alveolata, while the peatland lakes showed a more diverse microbial community, with Ciliophora, Chlorophyta and Chytrids among the more predominant groups. Furthermore, for the two bedrock‐dominated lakes—where the oldest DNA samples are dated to only a few hundred years after the lake formation—certain Alveolata, Chlorophytes, Stramenopiles and Rhizaria taxa were found prevalent throughout all the sediment profiles. Our work highlights the importance of species sorting due to landscape setting and the persistence of microbial eukaryotic diversity over millennial timescales in shaping modern lake microbial communities.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
MDPI, 2021. Vol. 9, nr 2, artikel-id 355
Nyckelord [en]
18S metabarcoding, Holocene, Lakes, Microbial eukaryotes, Sedimentary DNA
Nationell ämneskategori
Mikrobiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-180793DOI: 10.3390/microorganisms9020355ISI: 000622825300001Scopus ID: 2-s2.0-85100648541OAI: oai:DiVA.org:umu-180793DiVA, id: diva2:1531144
Tillgänglig från: 2021-02-25 Skapad: 2021-02-25 Senast uppdaterad: 2024-02-13Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2760 kB)139 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 2760 kBChecksumma SHA-512
0a414e15b4c17c0e9b9de84fe08c6c7c7502e50c890cf6e3597b29d900334417773eca0ed0cfa514f8c1ce80c71bdd31020a3578511a967b4ae41cb14d015eda
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Person

Capo, EricNinnes, SofiaBigler, ChristianWang, Xiao-RuBindler, RichardRydberg, Johan

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Capo, EricNinnes, SofiaBigler, ChristianWang, Xiao-RuBindler, RichardRydberg, Johan
Av organisationen
Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap
I samma tidskrift
Microorganisms
Mikrobiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 139 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 367 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf