Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Airborne eDNA captures the diversity and dynamics of a subarctic ecosystem across three decades
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten).
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap. Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Umeå Plant Science Centre (UPSC).ORCID-id: 0000-0003-2182-911x
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.ORCID-id: 0000-0002-4476-9255
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap.ORCID-id: 0000-0003-2544-7899
Visa övriga samt affilieringar
(Engelska)Manuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Forskningsämne
molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-189099OAI: oai:DiVA.org:umu-189099DiVA, id: diva2:1608675
Tillgänglig från: 2021-11-04 Skapad: 2021-11-04 Senast uppdaterad: 2021-11-09
Ingår i avhandling
1. Using airborne eDNA to study ecosystem dynamics
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Using airborne eDNA to study ecosystem dynamics
2021 (Engelska)Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
Abstract [en]

In this era of global biodiversity crisis, the need to monitor ecological communities over space and time is more pressing than ever to effectively direct biodiversity conservation and management efforts. To understand the natural dynamics of an ecosystem, and the impact of anthropogenic activities related to environmental and climate change, long time series are needed to accurately link such processes to ecosystem change. This thesis uses a unique resource of archived air filters collected in Sweden originally intended for radioactive particle measurements to reconstruct historical eDNA abundance in the most extensive time-series of airborne eDNA abundance to date - spanning across four decades. By using metabarcoding and metagenomic analysis, it is evident that airborne eDNA from a very large diversity of species is present in air, representing all major branches of the tree of life, including bacteria, fungi, plants, metazoans, and viruses, from a wide range of terrestrial and aquatic sources. These have seasonal as well as long term trends that in part can be explained by temporal variation in climate and regional differences. The data generated in this thesis comprise an extensive resource for analysis of trends related to climate and environmental change and will also allow deeper studies on phenology, phenological change, functional genomics, and potentially antibiotic resistance. The results presented here show the potential of using airborne eDNA to monitor species in the local ecosystem over time and the methods provides an efficient tool for assessment of broad scale biodiversity, in a non-invasive and cost-effective way.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Umeå: Umeå Universitet, 2021. s. 34
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi Ekologi Bioinformatik och systembiologi
Identifikatorer
urn:nbn:se:umu:diva-189117 (URN)978-91-7855-698-4 (ISBN)978-91-7855-697-7 (ISBN)
Disputation
2021-12-03, Betula, Norrlands Universitetssjukhus, Umeå, 10:00 (Engelska)
Opponent
Handledare
Tillgänglig från: 2021-11-12 Skapad: 2021-11-04 Senast uppdaterad: 2021-11-09Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Person

Karlsson, EdvinSullivan, Alexis R.Svensson, DanielBellieny-Rabelo, DanielSiddique, Abu BakarVillegas, José AntonioJohansson, Anna-MiaStenberg, Per

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Karlsson, EdvinSullivan, Alexis R.Svensson, DanielBellieny-Rabelo, DanielSiddique, Abu BakarVillegas, José AntonioJohansson, Anna-MiaStenberg, Per
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskapUmeå Plant Science Centre (UPSC)Kemiska institutionenInstitutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet)
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 526 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf