Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Frankia – ett släkte kvävefixerande bakterier: Biodiversitet, förekomst i jord och frö, samt påverkan på tillväxt hos havtorn
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap.
2021 (Svenska)Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
Abstract [en]

This study aimed to describe the biodiversity of the nitrogen-fixing symbiotic bacteria Frankia, to investigate the occurrence of Frankia in soil and seeds, and finally test the effect of a Frankia symbiosis on growth rate on Sea buckthorn (Hippophae rhamnoides) in an experiment. Data from the high-quality ribosomal gene database SILVA was used to reconstruct phylogenetic trees that revealed a genetic diversity in the genus that includes more strains than 16 described species so far. Strains of Frankia isolated from Sea buckthorn were found in cluster three, which also was the cluster of Frankia strains with the highest diversity in genera of plants possible for the symbiosis (actinorhizal plants).Maps of biogeographical diversity were created from the SILVA gene database and whole genome data from NCBI. Gene sequences of Frankia existed on all continents except Antarctica, which reflects the distribution of actinorhizal plants. From Sweden, only sequences of strains in cluster 1 in symbiosis with Alnus and Myrica were found, although Sea buckthorn is naturally distributed along the Swedish coast. DNA was extracted from seeds of Sea buckthorn and soil, in order to amplify gene sequences affiliated to Frankia, however the preliminary PCR results indicated that there was an issue of inhibition caused e.g. by humic substances – and which therefore would need more optimization.The experiment that was set up to study the relative growth rate (RGR) of Sea buckthorn plants inoculated with Frankia in comparison with controls did not show any difference in RGR during the first month of growth, which is a too short time for any further reliable interpretations. 

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2021. , s. 30
Nyckelord [en]
Frankia, Sea buckthorn, Nitrogen-fixation
Nationell ämneskategori
Botanik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-192126OAI: oai:DiVA.org:umu-192126DiVA, id: diva2:1634351
Presentation
2021-06-04, Digitalt via zoom, 11:10 (Svenska)
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2022-04-13 Skapad: 2022-02-02 Senast uppdaterad: 2022-04-13Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1049 kB)324 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1049 kBChecksumma SHA-512
331ae06b2f1ec4ed958fefec0123d5ebb291ec0cb4c0c8f6224b15c6a1f7450e7a3801fda3ee6245c742adcd23cf40b911ac5577358035252d969c0e3cde4e1a
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Nygren, Maria
Av organisationen
Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap
Botanik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 324 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 94 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf