Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
CRISPR/Cas9 and genetic screens in malaria parasites: small genomes, big impact
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO), Argentina.
Francis Crick Institute London, United Kingdom.
Visa övriga samt affilieringar
2022 (Engelska)Ingår i: Biochemical Society Transactions, ISSN 0300-5127, E-ISSN 1470-8752, Vol. 50, nr 3, s. 1069-1079Artikel, forskningsöversikt (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The ∼30 Mb genomes of the Plasmodium parasites that cause malaria each encode ∼5000 genes, but the functions of the majority remain unknown. This is due to a paucity of functional annotation from sequence homology, which is compounded by low genetic tractability compared with many model organisms. In recent years technical breakthroughs have made forward and reverse genome-scale screens in Plasmodium possible. Furthermore, the adaptation of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) and CRISPR-Associated protein 9 (CRISPR/Cas9) technology has dramatically improved gene editing efficiency at the single gene level. Here, we review the arrival of genetic screens in malaria parasites to analyse parasite gene function at a genome-scale and their impact on understanding parasite biology. CRISPR/Cas9 screens, which have revolutionised human and model organism research, have not yet been implemented in malaria parasites due to the need for more complex CRISPR/Cas9 gene targeting vector libraries. We therefore introduce the reader to CRISPR-based screens in the related apicomplexan Toxoplasma gondii and discuss how these approaches could be adapted to develop CRISPR/Cas9 based genome-scale genetic screens in malaria parasites. Moreover, since more than half of Plasmodium genes are required for normal asexual blood-stage reproduction, and cannot be targeted using knockout methods, we discuss how CRISPR/Cas9 could be used to scale up conditional gene knockdown approaches to systematically assign function to essential genes.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Portland Press, 2022. Vol. 50, nr 3, s. 1069-1079
Nyckelord [en]
Plasmodium falciparum, biochemical techniques and resources, CRISPR, genetics, malaria
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi Medicinsk bioteknologi (med inriktning mot cellbiologi (inklusive stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-197999DOI: 10.1042/BST20210281ISI: 000804375700001PubMedID: 35621119Scopus ID: 2-s2.0-85133214886OAI: oai:DiVA.org:umu-197999DiVA, id: diva2:1682676
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 2021-06602Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse, 2019.0178Wellcome trust, 210918/Z/18/ZTillgänglig från: 2022-07-11 Skapad: 2022-07-11 Senast uppdaterad: 2022-07-11Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4540 kB)359 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4540 kBChecksumma SHA-512
4c893d74ff831857bd11b42a3a562480c030a5fa898a76f943d6149f3e4dcafaa7c241b6eae9c07652efd3035f8161147a3dd39938cdd8b98bb50aca3a50dd00
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Ishizaki, TakahiroHernandez, SophiaPaoletta, Martina S.Bushell, Ellen

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Ishizaki, TakahiroHernandez, SophiaPaoletta, Martina S.Bushell, Ellen
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
I samma tidskrift
Biochemical Society Transactions
Cell- och molekylärbiologiMedicinsk bioteknologi (med inriktning mot cellbiologi (inklusive stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 359 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 702 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf