Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Ultrafast and selective labeling of endogenous proteins using affinity-based benzotriazole chemistry
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR).
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR).
Division of Physiological Chemistry I, Chemical Proteomics Core Facility, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden; Chemical Proteomics, Science for Life Laboratory (SciLifeLab), Stockholm, Sweden.
Division of Physiological Chemistry I, Chemical Proteomics Core Facility, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institute, Stockholm 17177, Sweden;Chemical Proteomics, Science for Life Laboratory (SciLifeLab), Stockholm, Sweden.
Visa övriga samt affilieringar
2022 (Engelska)Ingår i: Chemical Science, ISSN 2041-6520, E-ISSN 2041-6539, Vol. 13, nr 24, s. 7240-7246Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Chemical modification of proteins is enormously useful for characterizing protein function in complex biological systems and for drug development. Selective labeling of native or endogenous proteins is challenging owing to the existence of distinct functional groups in proteins and in living systems. Chemistry for rapid and selective labeling of proteins remains in high demand. Here we have developed novel affinity labeling probes using benzotriazole (BTA) chemistry. We showed that affinity-based BTA probes selectively and covalently label a lysine residue in the vicinity of the ligand binding site of a target protein with a reaction half-time of 28 s. The reaction rate constant is comparable to the fastest biorthogonal chemistry. This approach was used to selectively label different cytosolic and membrane proteins in vitro and in live cells. BTA chemistry could be widely useful for labeling of native/endogenous proteins, target identification and development of covalent inhibitors.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Royal Society of Chemistry, 2022. Vol. 13, nr 24, s. 7240-7246
Nyckelord [en]
affinity labeling, benzotriazole, inhibitors, ligand-directed chemistry, protein modifications
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi Annan kemi Organisk kemi
Forskningsämne
biologisk kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-199553DOI: 10.1039/d1sc05974bISI: 000806432100001PubMedID: 35799822Scopus ID: 2-s2.0-85131868228OAI: oai:DiVA.org:umu-199553DiVA, id: diva2:1697118
Forskningsfinansiär
Knut och Alice Wallenbergs StiftelseGöran Gustafssons stiftelse för naturvetenskaplig och medicinsk forskning (KVA)Vetenskapsrådet, 2018-04585EU, Horisont 2020, ChemBioAPScience for Life Laboratory, SciLifeLabTillgänglig från: 2022-09-20 Skapad: 2022-09-20 Senast uppdaterad: 2022-09-20Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(676 kB)123 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 676 kBChecksumma SHA-512
4163c11e51690c45f98c7d0e3ce7f8ed03c9ec8f02bdf02e34a6024d0a32c701818de9c23f0f7752acdce6b96b7a00289505ce51dab9967cd996b517d16496ef
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Xin, XiaoyiZhang, YuCorkery, Dale P.Wu, Yao-Wen

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Xin, XiaoyiZhang, YuCorkery, Dale P.Wu, Yao-Wen
Av organisationen
Kemiska institutionenUmeå Centre for Microbial Research (UCMR)
I samma tidskrift
Chemical Science
Biokemi och molekylärbiologiAnnan kemiOrganisk kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 123 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 277 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf