Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The use of an automated organism tracking microscope in mesocosm experiments
MicroWISE, Ebeltoft, Denmark.
MicroWISE, Ebeltoft, Denmark.
Latvian Institute of Aquatic Ecology, Riga, Latvia.
Marine Research Institute, Klaipėda University, Klaipėda, Lithuania.
Visa övriga samt affilieringar
2022 (Engelska)Ingår i: Limnology and Oceanography: Methods, E-ISSN 1541-5856, Vol. 20, nr 12, s. 768-780Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

A method for automatically counting and measuring sizes and motility behavior of zooplankton and phytoplankton in water samples is presented. Two video cameras are focused on separate optical chambers of different sizes. The chambers are filled and emptied repeatedly by synchronized pumps. Real-time motion analysis is performed by computer on the respective video feeds. Fluorescence from chlorophyll a (Chl a) is imaged at single pixel resolution. Measured parameters for individual organisms include size, swimming velocity, motility patterns, and chlorophyll fluorescence density. The system was tested during a mesocosm experiment where it was mounted on one of several mesocosm columns. The results were validated against Chl a measurements and microscopy counts. A sampling interval of 1 per day revealed detailed dynamics of chlorophyll activity as well as shifts in both the phytoplankton and zooplankton community structure over the course of a month. A helix coefficient, a metric related to organism motility behavior, showed substantial variation over time, consistent with changing plankton communities. Sampling rates as frequent as 1 per hour enables detailed analysis of diurnal vertical migration and similar phenomena at fixed sampling points.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
John Wiley & Sons, 2022. Vol. 20, nr 12, s. 768-780
Nationell ämneskategori
Oceanografi, hydrologi och vattenresurser Ekologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-200432DOI: 10.1002/lom3.10521ISI: 000869170600001Scopus ID: 2-s2.0-85140082859OAI: oai:DiVA.org:umu-200432DiVA, id: diva2:1704787
Forskningsfinansiär
Ecosystem dynamics in the Baltic Sea in a changing climate perspective - ECOCHANGETillgänglig från: 2022-10-19 Skapad: 2022-10-19 Senast uppdaterad: 2023-02-03Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2299 kB)110 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.pdfFilstorlek 2299 kBChecksumma SHA-512
1a286d597a27a5a5d486e833a14f78d2cf5d78b3ba4046aed069c74887a0241886562ffd9d4ae2a9d0afaf6bc8e01901b60150fcc0458bd71e7f4a3c85e73ca7
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Person

Brugel, SoniaAndersson, Agneta

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Brugel, SoniaAndersson, Agneta
Av organisationen
Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskapUmeå marina forskningscentrum (UMF)
I samma tidskrift
Limnology and Oceanography: Methods
Oceanografi, hydrologi och vattenresurserEkologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 145 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 252 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf