Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Enhanced mitochondrial G-quadruplex formation impedes replication fork progression leading to mtDNA loss in human cells
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik. Department of Women and Children Health, University of Padova, Padova, Italy.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Bioinformatics and Data Centre, Sahlgrenska Academy, University of Gothenburg, Gothenburg, Sweden.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik.
Visa övriga samt affilieringar
2023 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 51, nr 14, s. 7392-7408Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Mitochondrial DNA (mtDNA) replication stalling is considered an initial step in the formation of mtDNA deletions that associate with genetic inherited disorders and aging. However, the molecular details of how stalled replication forks lead to mtDNA deletions accumulation are still unclear. Mitochondrial DNA deletion breakpoints preferentially occur at sequence motifs predicted to form G-quadruplexes (G4s), four-stranded nucleic acid structures that can fold in guanine-rich regions. Whether mtDNA G4s form in vivo and their potential implication for mtDNA instability is still under debate. In here, we developed new tools to map G4s in the mtDNA of living cells. We engineered a G4-binding protein targeted to the mitochondrial matrix of a human cell line and established the mtG4-ChIP method, enabling the determination of mtDNA G4s under different cellular conditions. Our results are indicative of transient mtDNA G4 formation in human cells. We demonstrate that mtDNA-specific replication stalling increases formation of G4s, particularly in the major arc. Moreover, elevated levels of G4 block the progression of the mtDNA replication fork and cause mtDNA loss. We conclude that stalling of the mtDNA replisome enhances mtDNA G4 occurrence, and that G4s not resolved in a timely manner can have a negative impact on mtDNA integrity.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Oxford University Press, 2023. Vol. 51, nr 14, s. 7392-7408
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-214069DOI: 10.1093/nar/gkad535ISI: 001030190900001PubMedID: 37351621Scopus ID: 2-s2.0-85168980694OAI: oai:DiVA.org:umu-214069DiVA, id: diva2:1794279
Forskningsfinansiär
Knut och Alice Wallenbergs StiftelseVetenskapsrådet, VR-MH 2018-0278Vetenskapsrådet, VR-NT 2017-05235Kempestiftelserna, SMK-1632Wenner-Gren StiftelsernaEU, Horisont 2020, 751474Stiftelsen för strategisk forskning (SSF), RIF14-0081Tillgänglig från: 2023-09-05 Skapad: 2023-09-05 Senast uppdaterad: 2023-09-05Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1960 kB)71 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1960 kBChecksumma SHA-512
c34acb8e36d5067c5b60317b80496ba4818df9471db970dfe0bcdba4e2ea2aec4086a1aec3b3c881412ce438331cc6e3ca544aff8a18ba2f2dc7d319c1f1f477
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Doimo, MaraChaudhari, NamrataL'Hôte, ValentinNguyen, Tran V. H.Berner, AndreasNdi, MamaAbrahamsson, AlvaDas, Rabindra NathChorell, ErikWanrooij, Sjoerd

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Doimo, MaraChaudhari, NamrataL'Hôte, ValentinNguyen, Tran V. H.Berner, AndreasNdi, MamaAbrahamsson, AlvaDas, Rabindra NathChorell, ErikWanrooij, Sjoerd
Av organisationen
Institutionen för medicinsk kemi och biofysikKemiska institutionen
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
Cell- och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 74 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 298 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf