Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Structural insights into CodY activation and DNA recognition
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR). (Sauer-Eriksson)ORCID-id: 0000.0001.7282.1789
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen. QureTech Bio, Umeå, Sweden.ORCID-id: 0000-0003-4624-4337
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR).ORCID-id: 0000-0003-4646-0216
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR).ORCID-id: 0000-0002-0904-497x
Visa övriga samt affilieringar
2023 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 51, nr 14, s. 7631-7648Artikel i tidskrift, Letter (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Virulence factors enable pathogenic bacteria to infect host cells, establish infection, and contribute to disease progressions. In Gram-positive pathogens such as Staphylococcus aureus (Sa) and Enterococcus faecalis (Ef), the pleiotropic transcription factor CodY plays a key role in integrating metabolism and virulence factor expression. However, to date, the structural mechanisms of CodY activation and DNA recognition are not understood. Here, we report the crystal structures of CodY from Sa and Ef in their ligand-free form and their ligand-bound form complexed with DNA. Binding of the ligands - branched chain amino acids and GTP - induces conformational changes in the form of helical shifts that propagate to the homodimer interface and reorient the linker helices and DNA binding domains. DNA binding is mediated by a non-canonical recognition mechanism dictated by DNA shape readout. Furthermore, two CodY dimers bind to two overlapping binding sites in a highly cooperative manner facilitated by cross-dimer interactions and minor groove deformation. Our structural and biochemical data explain how CodY can bind a wide range of substrates, a hallmark of many pleiotropic transcription factors. These data contribute to a better understanding of the mechanisms underlying virulence activation in important human pathogens.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Oxford University Press, 2023. Vol. 51, nr 14, s. 7631-7648
Nyckelord [en]
CodY, virulence, protein-DNA complex structure
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi Bioinformatik och systembiologi
Forskningsämne
biokemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-214131DOI: 10.1093/nar/gkad512ISI: 001008706900001Scopus ID: 2-s2.0-85168963845OAI: oai:DiVA.org:umu-214131DiVA, id: diva2:1794435
Projekt
CodY
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, ID 2019-03771Vetenskapsrådet, 2020-02005_3 toVetenskapsrådet, 2018-04589Vetenskapsrådet, 2021-05040JTillgänglig från: 2023-09-05 Skapad: 2023-09-05 Senast uppdaterad: 2023-09-05Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2793 kB)79 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 2793 kBChecksumma SHA-512
d77d1efdbe000e69f497f3e646a19ca66beaaf6cf001f318bb0d7c19293dfd7108c3959f971c34730b990c763066e918a7930c2b3794240b1136f62fcc5a0f67
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Person

Hainzl, TobiasBonde, MariAlmqvist, FredrikJohansson, JörgenSauer-Eriksson, A. Elisabeth

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Hainzl, TobiasBonde, MariAlmqvist, FredrikJohansson, JörgenSauer-Eriksson, A. Elisabeth
Av organisationen
Kemiska institutionenUmeå Centre for Microbial Research (UCMR)Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
Biokemi och molekylärbiologiBioinformatik och systembiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 81 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 327 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf