Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Rewiring of the promoter-enhancer interactome and regulatory landscape in glioblastoma orchestrates gene expression underlying neurogliomal synaptic communication
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå centrum för molekylär medicin (UCMM). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå centrum för molekylär medicin (UCMM). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå centrum för molekylär medicin (UCMM). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå centrum för molekylär medicin (UCMM). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM).
Visa övriga samt affilieringar
2023 (Engelska)Ingår i: Nature Communications, E-ISSN 2041-1723, Vol. 14, nr 1, artikel-id 6446Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Chromatin organization controls transcription by modulating 3D-interactions between enhancers and promoters in the nucleus. Alterations in epigenetic states and 3D-chromatin organization result in gene expression changes contributing to cancer. Here, we map the promoter-enhancer interactome and regulatory landscape of glioblastoma, the most aggressive primary brain tumour. Our data reveals profound rewiring of promoter-enhancer interactions, chromatin accessibility and redistribution of histone marks in glioblastoma. This leads to loss of long-range regulatory interactions and overall activation of promoters, which orchestrate changes in the expression of genes associated to glutamatergic synapses, axon guidance, axonogenesis and chromatin remodelling. SMAD3 and PITX1 emerge as major transcription factors controlling genes related to synapse organization and axon guidance. Inhibition of SMAD3 and neuronal activity stimulation cooperate to promote proliferation of glioblastoma cells in co-culture with glutamatergic neurons, and in mice bearing patient-derived xenografts. Our findings provide mechanistic insight into the regulatory networks that mediate neurogliomal synaptic communication.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Springer Nature, 2023. Vol. 14, nr 1, artikel-id 6446
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-216189DOI: 10.1038/s41467-023-41919-xPubMedID: 37833281Scopus ID: 2-s2.0-85174178290OAI: oai:DiVA.org:umu-216189DiVA, id: diva2:1810780
Tillgänglig från: 2023-11-09 Skapad: 2023-11-09 Senast uppdaterad: 2023-11-09Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(7593 kB)38 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 7593 kBChecksumma SHA-512
00b51022eb7576eddedf70694ec09dcea7821d0f5103c41d41ce3e97e301650e139850fb1c73ff67784bbd1c02bc7aa060f4a3ac1c47b255d29d514c40cf71d7
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Chakraborty, ChaitaliNissen, ItzelVincent, Craig A.Hägglund, Anna-CarinHörnblad, AndreasRemeseiro, Silvia

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Chakraborty, ChaitaliNissen, ItzelVincent, Craig A.Hägglund, Anna-CarinHörnblad, AndreasRemeseiro, Silvia
Av organisationen
Umeå centrum för molekylär medicin (UCMM)Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM)
I samma tidskrift
Nature Communications
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 38 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 319 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf