Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Assessing CaDPA levels, metabolic activity, and spore detection through deuterium labeling
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för fysik. Swedish Defence Research Agency (FOI), Umeå, Sweden.ORCID-id: 0000-0002-0168-0197
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för fysik.ORCID-id: 0009-0003-0399-9569
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.ORCID-id: 0000-0002-3804-6421
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för fysik. (The Biophysics and Biophotonics group)ORCID-id: 0000-0002-9835-3263
Visa övriga samt affilieringar
2024 (Engelska)Ingår i: The Analyst, ISSN 0003-2654, E-ISSN 1364-5528, Vol. 149, nr 6, s. 1861-1871Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Many strains among spore-forming bacteria species are associated with food spoilage, foodborne disease, and hospital-acquired infections. Understanding the impact of environmental conditions and decontamination techniques on the metabolic activity, viability, and biomarkers of these spores is crucial for combatting them. To distinguish and track spores and to understand metabolic mechanisms, spores must be labeled. Staining or genetic modification are current methods for this, however, these methods can be time-consuming, and affect the viability and function of spore samples. In this work, we investigate the use of heavy water for permanent isotope labeling of spores and Raman spectroscopy for tracking sporulation/germination mechanisms. We also discuss the potential of this method in observing decontamination. We find that steady-state deuterium levels in the spore are achieved after only ∼48 h of incubation with 30% D2O-infused broth and sporulation, generating Raman peaks at cell silent region of 2200 and 2300 cm−1. These deuterium levels then decrease rapidly upon spore germination in non-deuterated media. We further find that unlike live spores, spores inactivated using various methods do not lose these Raman peaks upon incubation in growth media, suggesting these peaks may be used to indicate the viability of a spore sample. We further observe several Raman peaks exclusive to deuterated DPA, a spore-specific chemical biomarker, at e.g. 988 and 2300 cm−1, which can be used to track underlying changes in spores involving DPA. In conclusion, permanent spore labeling using deuterium offers a robust and non-invasive way of labeling bacterial spores for marking, viability determination, and characterising spore activity.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Royal Society of Chemistry, 2024. Vol. 149, nr 6, s. 1861-1871
Nationell ämneskategori
Annan fysik Analytisk kemi Annan biologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-221377DOI: 10.1039/d3an02162aISI: 001160646800001PubMedID: 38348676Scopus ID: 2-s2.0-85185190708OAI: oai:DiVA.org:umu-221377DiVA, id: diva2:1839729
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 2019-04016Kempestiftelserna, JCK-1916.2Försvarsmakten, 470-A400823Tillgänglig från: 2024-02-21 Skapad: 2024-02-21 Senast uppdaterad: 2024-03-21Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2146 kB)22 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.pdfFilstorlek 2146 kBChecksumma SHA-512
87907a8a54f53500e13698d7d26aa06617431cfeaf6e1b0468e53abfffe6b0c4fa4c58d91ce56ff2c3e363b34a94972b138278c109ee335ec643b2a8c8f5030c
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Öberg, RasmusSil, Timir BaranOhlin, C. AndréAndersson, MagnusMalyshev, Dmitry

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Öberg, RasmusSil, Timir BaranOhlin, C. AndréAndersson, MagnusMalyshev, Dmitry
Av organisationen
Institutionen för fysikKemiska institutionen
I samma tidskrift
The Analyst
Annan fysikAnalytisk kemiAnnan biologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 42 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 330 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf