Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Extending evolutionary forecasts across bacterial species
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten). Los Alamos National Laboratory, NM, Los Alamos, United States.ORCID-id: 0000-0002-8186-3005
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten).
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR). Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet).ORCID-id: 0000-0003-1510-8324
2024 (Engelska)Ingår i: Proceedings of the Royal Society of London. Biological Sciences, ISSN 0962-8452, E-ISSN 1471-2954, Vol. 291, nr 2036, artikel-id 20242312Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Improving evolutionary forecasting requires progressing from studying repeated evolution of a single genotype under identical conditions to formulating broad principles. These principles should enable predictions of how similar species will adapt to similar selective pressures. Evolve-and-resequence experiments with multiple species allow testing forecasts on different biological levels and elucidating the causes for failed predictions. Here, we show that forecasts for adaptation to static culture conditions can be extended to multiple species by testing previous predictions for Pseudomonas syringae and Pseudomonas savastanoi. In addition to sequence divergence, these species differ in their repertoire of biofilm regulatory genes and structural components. Consistent with predictions, both species repeatedly produced biofilm mutants with a wrinkly spreader phenotype. Predominantly, mutations occurred in the wsp operon, with less frequent promoter mutations near uncharacterized diguanylate cyclases. However, mutational patterns differed on the gene level, which was explained by a lack of conservation in relative fitness of mutants between more divergent species. The same mutation was the most frequent for both species suggesting that conserved mutation hotspots can increase parallel evolution. This study shows that evolutionary forecasts can be extended across species, but that differences in the genotype-phenotype-fitness map and mutational biases limit predictability on a detailed molecular level.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Royal Society Publishing , 2024. Vol. 291, nr 2036, artikel-id 20242312
Nyckelord [en]
c-di-GMP, evolutionary predictability, experimental evolution, Pseudomonas savastanoi, Pseudomonas syringae, wrinkly spreader
Nationell ämneskategori
Genetik och genomik Evolutionsbiologi Biokemi Molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-233547DOI: 10.1098/rspb.2024.2312ISI: 001377212400013PubMedID: 39657800Scopus ID: 2-s2.0-85212245196OAI: oai:DiVA.org:umu-233547DiVA, id: diva2:1926314
Tillgänglig från: 2025-01-10 Skapad: 2025-01-10 Senast uppdaterad: 2025-02-20Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1786 kB)80 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1786 kBChecksumma SHA-512
4fbcbe352cf401b74b094fac79dd0f9e95e6ea6712e74fe6d8cd6941e058e44fad819427fc8a0734165538777609a9f835b8a256d55dd50b8152124be7cd08bd
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Pentz, Jennifer T.Lind, Peter A

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Pentz, Jennifer T.Biswas, AparnaLind, Peter A
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Umeå Centre for Microbial Research (UCMR)Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet)
I samma tidskrift
Proceedings of the Royal Society of London. Biological Sciences
Genetik och genomikEvolutionsbiologiBiokemiMolekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 80 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 403 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf