Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Genomic surveillance of Salmonella enterica serotype Minnesota strains from poultry products imported into South Africa
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR).ORCID-id: 0000-0002-7435-6435
Department of Biochemistry, University of Johannesburg, Auckland Park, South Africa.
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR).ORCID-id: 0009-0005-8315-5343
Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS). Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Umeå Centre for Microbial Research (UCMR).ORCID-id: 0000-0001-9807-1082
Visa övriga samt affilieringar
2026 (Engelska)Ingår i: Microbial Genomics, E-ISSN 2057-5858, Vol. 12, nr 2, artikel-id 001633Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Salmonella enterica subspecies enterica serotype Minnesota (S. Minnesota) has recently emerged as a predominant serotype in poultry farming operations. Genomic surveillance efforts concentrated primarily in Europe have been used to evaluate food safety risks associated with S. Minnesota in imported poultry/poultry products. However, the burden imposed by S. Minnesota on consumers in sub-Saharan Africa is not understood. Here, we used whole-genome sequencing to characterize 36 S. Minnesota strains from raw poultry imported into South Africa, specifically (i) 11 strains isolated at port of entry and (ii) 25 strains from imported poultry in South African supermarkets. While all 36 strains belonged to the same sequence type (ST548), multiple ST548 lineages were present among poultry products. Comparison of the 36 strains sequenced here to all publicly available, high-quality ST548 genomes (n=460, from Enterobase) identified several public genomes differing by <30 core SNPs, including strains isolated previously from South American poultry imported into the UK. Notably, a cluster consisting of 14 highly similar genomes sequenced here (0 core SNPs) uniquely possessed blaCTX-M-8. A search of plasmids in public databases, alongside antimicrobial resistance (AMR) genes from >1.9 million bacterial genomes, revealed that this cluster harboured blaCTX-M-8 on an IncI1 plasmid-like region, which we hypothesize was acquired recently, from Escherichia coli. Overall, our study provides insight into the intercontinental dissemination of S. Minnesota and its associated AMR determinants via the global poultry trade.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Microbiology Society, 2026. Vol. 12, nr 2, artikel-id 001633
Nyckelord [en]
antimicrobial resistance, beta-lactamase, CTX-M-8, poultry, Salmonella Minnesota, whole-genome sequencing
Nationell ämneskategori
Mikrobiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-249936DOI: 10.1099/mgen.0.001633PubMedID: 41642222Scopus ID: 2-s2.0-105029609531OAI: oai:DiVA.org:umu-249936DiVA, id: diva2:2039843
Forskningsfinansiär
Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse, KAW 2020.0239Vetenskapsrådet, 2023-05212
Anmärkning

Nya ämnen i SSIF2025 i samma forskningsämnesgrupp: 10616(Molekylärbiologi)

Tillgänglig från: 2026-02-18 Skapad: 2026-02-18 Senast uppdaterad: 2026-02-18Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4755 kB)34 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4755 kBChecksumma SHA-512
d4c45ec4b16ab13332321bf90b615746b1646cb1c475dbabe7218c4705bcd6374fb842d895fa5e65b7ec8e66b332f20154e36a6953ba8c19f6738a2903df58d3
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Raghuram, VishnuRamnath, VigneshGourlé, HadrienBlom, JosefinCarroll, Laura M.

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Raghuram, VishnuRamnath, VigneshGourlé, HadrienBlom, JosefinCarroll, Laura M.
Av organisationen
Institutionen för klinisk mikrobiologiMolekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)Umeå Centre for Microbial Research (UCMR)
I samma tidskrift
Microbial Genomics
Mikrobiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 3204 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf