Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Driftstörningar
Det förekommer återkommande driftstörningar på några av sök-portalerna på grund av hög belastning. Vi arbetar på att lösa problemet, ni kan tillfälligt mötas av ett felmeddelande.
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Systematic profiling of growth interactions in human gut microbiome species
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten).
Visa övriga samt affilieringar
2026 (Engelska)Ingår i: Nature Communications, E-ISSN 2041-1723, Vol. 17, nr 1, artikel-id 8012Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Microbial interactions shape the composition and stability of the human gut microbiome. Yet, few studies have systematically investigated species-species growth interactions and the mechanisms behind these. Here we show that among 36 representative gut bacterial strains, when two species interact, the interactions are mostly inhibitory. To provide biological insight into specific interactions, we further investigate the basis of a positive interaction, showing that Clostridium perfringens promotes the growth of Mediterraneibacter gnavus through extracellular vesicles. Additionally, we identify Veillonella parvula as a species capable of modulating environmental pH, thereby enabling the growth of Parabacteroides merdae, a strain highly sensitive to acidic conditions. This pH-increasing effect is enhanced by guanine supplementation and persists in multi-species communities containing different pH-lowering strains from diverse bacterial phyla. Although V. parvula is commonly present in human gut microbiomes, it is generally found at low levels. Given the spatial organization of bacteria in the gut, the local pH modulation by V. parvula might support the growth of acid-sensitive strains. Overall, the comprehensive dataset and mechanistic insights presented here provide a starting point to predict microbiome composition by integrating growth interactions.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Nature Portfolio, 2026. Vol. 17, nr 1, artikel-id 8012
Nationell ämneskategori
Mikrobiologi Mikrobiologi inom det medicinska området
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-257842DOI: 10.1038/s41467-026-76526-zISI: 001843797100002PubMedID: 42567864Scopus ID: 2-s2.0-105046699594OAI: oai:DiVA.org:umu-257842DiVA, id: diva2:2096577
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 2022-02958Vetenskapsrådet, 2022-02973Vetenskapsrådet, 2022-00981Vetenskapsrådet, 2025-02844EU, Europeiska forskningsrådet, 101076015Knut och Alice Wallenbergs StiftelseKempestiftelserna, JCK3126Tillgänglig från: 2026-08-31 Skapad: 2026-08-31 Senast uppdaterad: 2026-08-31Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(8638 kB)39 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 8638 kBChecksumma SHA-512
9065e8fd2bc6f9618ef22ef39c35f3477674ea0ba6034c8f73e0cf55ad8287bf9e05a322d54ffe6d1a7558ab5a74b6f598769dcbd72fa7f2476454fb97857251
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Person

Buyanbadrakh, BolorBaland, ElisabethPérez, LucíaHolmberg, SandraPuértolas Balint, FabiolaToh, EricWai, Sun NyuntSchröder, BjörnRamstedt, MadeleineZhu, ShaochunMateus, André

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Buyanbadrakh, BolorBaland, ElisabethLambeck, PaulaPérez, LucíaHolmberg, SandraPuértolas Balint, FabiolaToh, EricWai, Sun NyuntSchröder, BjörnRamstedt, MadeleineZhu, ShaochunMateus, André
Av organisationen
Kemiska institutionenInstitutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)Umeå Centre for Microbial Research (UCMR)
I samma tidskrift
Nature Communications
MikrobiologiMikrobiologi inom det medicinska området

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 349 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf