Umeå universitets logga

umu.sePublikationer
Driftstörningar
Det förekommer återkommande driftstörningar på några av sök-portalerna på grund av hög belastning. Vi arbetar på att lösa problemet, ni kan tillfälligt mötas av ett felmeddelande.
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Two groups of phenylalanine biosynthetic operon leader peptides genes: a high level of apparently incidental frameshifting in decoding Escherichia coli pheL
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet).
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet). (Björk)
Visa övriga samt affilieringar
2011 (Engelska)Ingår i: Nucleic Acids Research, ISSN 0305-1048, E-ISSN 1362-4962, Vol. 39, nr 8, s. 3079-3092Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The bacterial pheL gene encodes the leader peptide for the phenylalanine biosynthetic operon. Translation of pheL mRNA controls transcription attenuation and, consequently, expression of the downstream pheA gene. Fifty-three unique pheL genes have been identified in sequenced genomes of the gamma subdivision. There are two groups of pheL genes, both of which are short and contain a run(s) of phenylalanine codons at an internal position. One group is somewhat diverse and features different termination and 5’-flanking codons. The other group, mostly restricted to Enterobacteria and including Escherichia coli pheL, has a conserved nucleotide sequence that ends with UUC_CCC_UGA. When these three codons in E. coli pheL mRNA are in the ribosomal E-, P- and A-sites, there is an unusually high level, 15%, of +1 ribosomal frameshifting due to features of the nascent peptide sequence that include the penultimate phenylalanine. This level increases to 60% with a natural, heterologous, nascent peptide stimulator. Nevertheless, studies with different tRNA(Pro) mutants in Salmonella enterica suggest that frameshifting at the end of pheL does not influence expression of the downstream pheA. This finding of incidental, rather than utilized, frameshifting is cautionary for other studies of programmed frameshifting.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2011. Vol. 39, nr 8, s. 3079-3092
Nyckelord [en]
translation termination; transfer-rna; salmonella-typhimurium; nascent-peptide; messenger-rna; attenuation regulation; coding gap; in-vivo; ribosome; expression
Nationell ämneskategori
Biokemi Molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:umu:diva-43186DOI: 10.1093/nar/gkq1272PubMedID: 21177642Scopus ID: 2-s2.0-79955622323OAI: oai:DiVA.org:umu-43186DiVA, id: diva2:412350
Tillgänglig från: 2011-04-22 Skapad: 2011-04-22 Senast uppdaterad: 2025-02-20Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopushttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21177642

Person

Björk, Glenn R

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Björk, Glenn R
Av organisationen
Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet)
I samma tidskrift
Nucleic Acids Research
BiokemiMolekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 655 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf