År 1942 startades Samernas folkhögskola (SF) av Svenska Missionssällskapet (SMS). Från år 1945 var verksamheten förlagd till Jokkmokk. Skolans mål: förbereda unga samer för det moderna Sverige och förse dem med fördjupade kunskaper i den samiska kulturen och fostran i kristna värderingar. SMS ordförande var boiskop i Luleå och organisationen var integrerad i Svenska kyrkan. Den prästvigde Lennart Wallmark tillsattes vid starten som rektor, en tjänst som han hade i nästan 30 år. Wallmarks uppfattning om vad de unga samerna behövde påverkade undervisningen. Där fanns allmänna skolämnen, och stora inslag av praktiska skolämnen främst slöjd. Efter några år anpassades mer efter planen för folkhögskolornas allmänna linje. Det innebar mer tid till med mer tid till teoretiska skolämnen. Samisk slöjd hade detta till trots ett stort utrymme i timplanen. Undervisningen i samiska var problematisk med få elever och dålig tillgång på lärare i de olika språken. Utöver undervisningen ordnades gästföreläsningar, studiebesök och skolresor. Den religiösa närvaron vid SF var stark och tog sig bland annat uttryck i strikta ordningsregler och deltagande i gudstjänster. På 1960-talet minskade elevantalet, trots åtgärder som att tillåta icke-samiska elever. Detta tillsammans med att Svenska kyrkan inte längre gav bidrag till verksamheten gjorde att SMS lämnade SF i början av 1970-talet. Då trädde i stället en stiftelse in som huvudman, där såväl samiska organisationer som företrädare för Jokkmokks kommun var representerade, en ordning som består än i dag.
Websida för De historiska relationerna mellan Svenska kyrkan och samerna:
https://www.svenskakyrkan.se/vitboken